RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TBPP20226 339 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ADD2P35612 726 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LBX1P52954 281 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FUT7Q11130 342 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FOXO1Q12778 655 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NHLRC3Q5JS37 347 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AVL9Q8NBF6 648 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF128Q8TEB7 428 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TBC1D20Q96BZ9 403 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EGLN2Q96KS0 407 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SGCZQ96LD1 299 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RANBP9Q96S59 729 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PAXXQ9BUH6 204 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NYXQ9GZU5 481 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MARCH7Q9H992 704 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KIF9Q9HAQ2 790 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EPB41L5Q9HCM4 733 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CACNG4Q9UBN1 327 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RSPH14Q9UHP6 348 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CAPN7Q9Y6W3 813 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PIAS3Q9Y6X2 628 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAU2Q9Y6X3 613 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A0A087WV62 115 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GAGE10A6NGK3 116 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LRRC53A6NM62 1247 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CAND2O75155 1236 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF253O75346 499 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CNPP09543 421 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRKAR1AP10644 381 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IL7RP16871 459 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PTGER4P35408 488 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SUOXP51687 545 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARSEP51690 589 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NDST2P52849 883 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SRPXP78539 464 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DMPKQ09013 629 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KIAA0040Q15053 153 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANKRD1Q15327 319 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MEP1AQ16819 746 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WSCD2Q2TBF2 565 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC22A6Q4U2R8 563 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LRRC31Q6UY01 552 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GALNT13Q8IUC8 556 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF491Q8N8L2 437 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RUBCNQ92622 972 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KLHL15Q96M94 604 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OLFM1Q99784 485 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MMACHCQ9Y4U1 282 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 A8MV72 311 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TEX28O15482 410 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SNAI2O43623 268 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SCO2O43819 266 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TSPAN3O60637 253 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CPN1P15169 458 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MYOGP15173 224 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GDF1P27539 372 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GGT5P36269 586 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCR3P51677 355 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RIDAP52758 137 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AK2P54819 239 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CREB5Q02930 508 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HERC3Q15034 1050 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TAZQ16635 292 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TIGD6Q17RP2 521 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MDH1BQ5I0G3 518 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPDYCQ5MJ68 293 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GRTP1Q5TC63 336 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANKRD45Q5TZF3 282 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GALNT5Q7Z7M9 940 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CEP97Q8IW35 865 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TSPYL6Q8N831 410 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GSDMBQ8TAX9 411 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IL22RA2Q969J5 263 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HDAC11Q96DB2 347 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LPAR4Q99677 370 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 S1PR5Q9H228 398 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PKD2L2Q9NZM6 624 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPAP1Q9NZP6 1156 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TSPYL4Q9UJ04 414 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SNAP23O00161 211 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms