RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 NCSTNQ92542 709 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 HDAC11Q96DB2 347 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIB3Q96RU7 358 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 GPHA2Q96T91 129 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 CTRCQ99895 268 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF670Q9BS34 389 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 EFHD1Q9BUP0 239 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 NUP85Q9BW27 656 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 PCDH9Q9HC56 1237 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 APMAPQ9HDC9 416 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 A8MU76 341 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF487B1APH4 448 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR89AB7ZAQ6 455 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 FZD7O75084 574 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 STK17BO94768 372 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 PROSCO94903 275 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 MBD3O95983 291 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 JCHAINP01591 159 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR89BP0CG08 455 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ACP5P13686 325 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC2A4P14672 509 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 BRAFP15056 766 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 CA4P22748 312 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 LSP1P33241 339 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 DCDC1P59894 354 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ZBED6P86452 979 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 CDC20Q12834 499 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT81Q14533 505 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 HADHQ16836 314 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 GAGE13Q4V321 117 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 USP51Q70EK9 711 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 C11orf96Q7Z7L8 435 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 VSIG1Q86XK7 387 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF547Q8IVP9 402 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC13Q8IYE1 715 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 PLD5Q8N7P1 536 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 AVL9Q8NBF6 648 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 KCTD6Q8NC69 237 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 GPR26Q8NDV2 337 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 RAPGEF5Q92565 580 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 C9orf72Q96LT7 481 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 RNF157Q96PX1 679 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 RAB33BQ9H082 229 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGEE1Q9HCI5 957 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC40A1Q9NP59 571 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 WASH6PQ9NQA3 447 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNK6Q9Y257 313 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.24□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 UBE2QL1A1L167 161 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNK1O00180 336 aa6.23□□□□□ -1.41
PRPF40A-210ENST00000489741 KMOO15229 486 aa6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms