RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 EGFL8Q99944 293 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 GSDMCQ9BYG8 508 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 CD244Q9BZW8 370 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 WWP1Q9H0M0 922 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 PRORYQ9H606 182 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 COG4Q9H9E3 785 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-207ENST00000475558 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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SHQ1-207ENST00000475558 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
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SHQ1-207ENST00000475558 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.84□□□□□ -1.31
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SHQ1-207ENST00000475558 USH1CQ9Y6N9 552 aa6.84□□□□□ -1.31
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SHQ1-207ENST00000475558 CXCR2P25025 360 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 CD38P28907 300 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 SEC24CP53992 1094 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 PNLIPRP1P54315 467 aa6.83□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 FGL2Q14314 439 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 KRT33BQ14525 404 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF460Q14592 562 aa6.83□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 DHRS13Q6UX07 377 aa6.83□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 Q6ZSR6 202 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 PIM3Q86V86 326 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.83□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 SPATA6LQ8N4H0 392 aa6.83□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 OR9A1PQ8NGU1 263 aa6.83□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 UBTD2Q8WUN7 234 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 SNX19Q92543 992 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 UBE2E3Q969T4 207 aa6.83□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 PHF21BQ96EK2 531 aa6.83□□□□□ -1.32
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SHQ1-207ENST00000475558 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 HGH1Q9BTY7 390 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 NTMT1Q9BV86 223 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 TM9SF3Q9HD45 589 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 NMRK1Q9NWW6 199 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.83□□□□□ -1.32
SHQ1-207ENST00000475558 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.83□□□□□ -1.32
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