RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TUBD1Q9UJT1 453 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLCL2Q9UPR0 1127 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNMB2Q9Y691 235 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC188H7C350 402 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTI1O43156 1089 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HAUS5O94927 633 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTC4O95801 387 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CAPN1P07384 714 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAB40ALP0C0E4 278 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERVK-10P10266 1014 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSMB5P28074 263 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PAFAH1B1P43034 410 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NFKB2Q00653 900 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CUL1Q13616 776 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL10RAQ13651 578 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MORF4L2Q15014 288 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CYP2A13Q16696 494 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UGT8Q16880 541 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FCRL6Q6DN72 434 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEC14L1Q92503 715 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PWWP2AQ96N64 755 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR21Q99679 349 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NLNQ9BYT8 704 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM117AQ9C073 453 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EURLQ9NYK6 297 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa14.97□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A1W2PPV9 198 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYO1CO00159 1063 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FKBP9O95302 570 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERGP11308 486 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GRIA3P42263 894 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1orf189Q5VU69 101 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM69BQ5VUD6 431 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RHBDD2Q6NTF9 364 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TLDC1Q6P9B6 456 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FIGLAQ6QHK4 219 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD200R1Q8TD46 325 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MIPEPQ99797 713 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAT9Q9BTE0 207 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLAC1Q9HBJ0 212 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RNF14Q9UBS8 474 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TCFL5Q9UL49 500 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNX7Q9UNH6 387 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DHRS7Q9Y394 339 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 COMMD10Q9Y6G5 202 aa14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC28A2O43868 658 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CATP04040 527 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CBSLP0DN79 551 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AGXTP21549 392 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CBSP35520 551 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ELK3P41970 407 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ITGA8P53708 1063 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PMS2P54278 862 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NCF4Q15080 339 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDIK1LQ8N165 341 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2L3Q8NG85 312 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 INPP5DQ92835 1189 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CERS2Q96G23 380 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CFAP36Q96G28 342 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GBP5Q96PP8 586 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRT12Q99456 494 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PKP4Q99569 1192 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NDNQ99608 321 aa14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms