RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ST6GAL1	P15907	406 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	STMN1	P16949	149 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2AD	P20671	130 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CCND1	P24385	295 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	UCN	P55089	124 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TAS2R39	P59534	338 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FOXM1	Q08050	763 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TUBB3	Q13509	450 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	DTX1	Q86Y01	620 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	KCNE4	Q8WWG9	221 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	OR6C1	Q96RD1	312 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PKP4	Q99569	1192 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SPRY4	Q9C004	299 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	DERL2	Q9GZP9	239 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	RARRES3	Q9UL19	164 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	RAX	Q9Y2V3	346 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SPTB	P11277	2137 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CCNDBP1	O95273	360 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SLC16A8	O95907	504 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	MT-ND3	P03897	115 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SLC26A3	P40879	764 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PNLIPRP1	P54315	467 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CDKL1	Q00532	357 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CCSMST1	Q4G0I0	132 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TEX35	Q5T0J7	233 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ATL1	Q8WXF7	558 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	IL17F	Q96PD4	163 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	GPAM	Q9HCL2	828 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PDE10A	Q9Y233	779 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	14.11	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CACNA1B	Q00975	2339 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PPV9	198 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241		E7ENX8	843 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	EBLN1	P0CF75	366 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FOLR1	P15328	257 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	HRH2	P25021	359 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CNTF	P26441	200 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CRABP2	P29373	138 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINB9	P50453	376 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ATP1A2	P50993	1020 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	RAB10	P61026	200 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SH3BP2	P78314	561 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ABAT	P80404	500 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TAP2	Q03519	686 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	RELA	Q04206	551 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CEP97	Q8IW35	865 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF480	Q8WV37	535 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	DLG3	Q92796	817 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PPM1M	Q96MI6	270 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	NRTN	Q99748	197 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	FAM117A	Q9C073	453 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PIAS1	O75925	651 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	STK17B	O94768	372 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ACSL3	O95573	720 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	DLGAP3	O95886	979 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	INHBA	P08476	426 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	IMPA1	P29218	277 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CMPK1	P30085	196 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PMS2	P54278	862 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ATP6V0D1	P61421	351 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CLN3	Q13286	438 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PTPA-222	ENST00000445241	BROX	Q5VW32	411 aa		14.09	□□□□□ -0.15

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