RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 MILR1Q7Z6M3 343 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PIANPQ8IYJ0 282 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CLIP4Q8N3C7 705 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 LIX1Q8N485 282 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CARNMT1Q8N4J0 409 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KCNJ9Q92806 393 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 OR52E6Q96RD3 313 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.58□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SPNP16150 400 aa14.57□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 OR2T29Q8NH02 315 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 C8orf48Q96LL4 319 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.57□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 IPPKQ9H8X2 491 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.57□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 C2orf81A6NN90 581 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 E5RI56 91 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PAX3P23760 479 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 GTF2H3Q13889 308 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DESI1Q6ICB0 168 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PNCKQ6P2M8 343 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 C10orf111Q8N326 155 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FCGR1BQ92637 280 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CRISPLD1Q9H336 500 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PARVBQ9HBI1 364 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 NEK6Q9HC98 313 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.57□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SLC28A1O00337 649 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RAD51BO15315 384 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 AIREO43918 545 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 EOMESO95936 686 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF45Q02386 682 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PROX2Q3B8N5 592 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 AHSA2Q719I0 299 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RNF180Q86T96 592 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 RMDN1Q96DB5 314 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PDFQ9HBH1 243 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.085e-7■□□□□ 11.3
TOP3B-206ENST00000436282 RNF186Q9NXI6 227 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ABCG2Q9UNQ0 655 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DRGXA6NNA5 263 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 PER2O15055 1255 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 HOXA9P31269 272 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 LIPAP38571 399 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TRPC1P48995 793 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KCNQ1P51787 676 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 CLCN4P51793 760 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.56□□□□□ -0.08
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TOP3B-206ENST00000436282 NDEL1Q9GZM8 345 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ZFP14Q9HCL3 533 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 ASIC5Q9NY37 505 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 IL37Q9NZH6 218 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SEC22BO75396 215 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FPR1P21462 350 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 MC4RP32245 332 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 GNPDA1P46926 289 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 DUSP4Q13115 394 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SYT16Q17RD7 645 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 FAM26DQ5JW98 314 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 USP43Q70EL4 1123 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 SLC22A15Q8IZD6 547 aa14.56□□□□□ -0.08
TOP3B-206ENST00000436282 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
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