RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 TTC23LQ6PF05 361 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 LRRC6Q86X45 466 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 FAM26EQ8N5C1 309 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 DTWD1Q8N5C7 304 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PRELID2Q8N945 189 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 TRIM58Q8NG06 486 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 OR2Y1Q8NGV0 311 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 RAD51AP1Q96B01 352 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MIPEPQ99797 713 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 KIFC1Q9BW19 673 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SLC22A11Q9NSA0 550 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 VPS4AQ9UN37 437 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.92□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CLEC18AA5D8T8 446 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 AP3B1O00203 1094 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PEX12O00623 359 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 AVILO75366 819 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 UMODP07911 640 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ITGAXP20702 1163 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 GPS1Q13098 491 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 KCNJ11Q14654 390 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ANKRD22Q5VYY1 191 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SLC6A19Q695T7 634 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MRNIPQ6NTE8 343 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CASC4Q6P4E1 433 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 Q8NA96 180 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CLEC18CQ8NCF0 446 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 LPGAT1Q92604 370 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 DLG3Q92796 817 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 COL26A1Q96A83 441 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 FOPNLQ96NB1 174 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 BIRC8Q96P09 236 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SELENOSQ9BQE4 189 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SLAMF7Q9NQ25 335 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 P4HTMQ9NXG6 502 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 GALPQ9UBC7 116 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 RELNP78509 3460 aa14.91□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 A0A0J9YVX5 310 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 A0A1B0GX78 115 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 BLACEA4D250 179 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 KPNA5O15131 536 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 KRT14P02533 472 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CHRM3P20309 590 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 GCGRP47871 477 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ARSFP54793 590 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CYP2A13Q16696 494 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 DCAF10Q5QP82 559 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 TTC27Q6P3X3 843 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 COX15Q7KZN9 410 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PTERQ96BW5 349 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MS4A14Q96JA4 679 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 CUTCQ9NTM9 273 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 MAU2Q9Y6X3 613 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 ESPL1Q14674 2120 aa14.9□□□□□ -0.02
ACTB-202ENST00000414620 PTPN13Q12923 2485 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 GOLGA8MH3BSY2 632 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 DSCR3O14972 297 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CTSVO60911 334 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CD63P08962 238 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 OR1D4P47884 311 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 GRM7Q14831 915 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ACSBG2Q5FVE4 666 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms