RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411297.1

RN7SKP270-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 270, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP270, Length 312 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP270-201ENST00000411297 TOXO94900 526 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 LY6G6DO95868 133 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 MX2P20592 715 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 CHRNB4P30926 498 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 SHMT2P34897 504 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 GRIA3P42263 894 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 CHRNA4P43681 627 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 PRLHRP49683 370 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ARSEP51690 589 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 AP1B1Q10567 949 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ATG9BQ674R7 924 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 FGD2Q7Z6J4 655 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 TAX1BP1Q86VP1 789 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 BEST3Q8N1M1 668 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ZNF398Q8TD17 642 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 DENND1AQ8TEH3 1009 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 DCUN1D1Q96GG9 259 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 YIPF2Q9BWQ6 316 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 SMOXQ9NWM0 555 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 STMN3Q9NZ72 180 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 IL17CQ9P0M4 197 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 PKP3Q9Y446 797 aa9.5□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 KLHL33A6NCF5 533 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 IDSB3KWA1 339 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 CTAG2O75638 210 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 MED26O95402 600 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ONECUT2O95948 504 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 FTLP02792 175 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 TPM2P07951 284 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 FERP16591 822 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 FBLP22087 321 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 PTGER1P34995 402 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 GRM7Q14831 915 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 KRT31Q15323 416 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 SIRPB2Q5JXA9 342 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 KDELC1Q6UW63 502 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 SIAH3Q8IW03 269 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 SELENOSQ9BQE4 189 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ASB8Q9H765 288 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ZNF304Q9HCX3 659 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 TEKT2Q9UIF3 430 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 CRLS1Q9UJA2 301 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ASF1AQ9Y294 204 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ASB1Q9Y576 335 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.49□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 RASGRF2O14827 1237 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 STX7O15400 261 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 RALBP11234 206 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ZNF24P17028 368 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 EMP2P54851 167 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 TUBA3CQ13748 450 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 BRD3Q15059 726 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 OR1C1Q15619 314 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 SPINK14Q6IE38 97 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 ZNF449Q6P9G9 518 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 CPNE8Q86YQ8 564 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 CLYBLQ8N0X4 340 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 PQLC3Q8N755 202 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 KCTD6Q8NC69 237 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 MDS2Q8NDY4 140 aa9.48□□□□□ -0.89
RN7SKP270-201ENST00000411297 LILRB4Q8NHJ6 448 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms