RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 CASTOR2A6NHX0 329 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ATP6AP2O75787 350 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 MOCS3O95396 460 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 PIGNO95427 931 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 GSRP00390 522 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TSHBP01222 138 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 CRYAAP02489 173 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 VIMP08670 466 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 LIFP15018 202 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 PAX1P15863 534 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 HSD17B3P37058 310 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 RGS7P49802 495 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 DLX5P56178 289 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 PTENP60484 403 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 PTGISQ16647 500 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 CDO1Q16878 200 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TYSND1Q2T9J0 566 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF718Q3SXZ3 478 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 WDR38Q5JTN6 314 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 CYP4A22Q5TCH4 519 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 GDPD4Q6W3E5 623 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJC22Q8N4W6 341 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ATAD1Q8NBU5 361 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 KLHDC9Q8NEP7 349 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 OR4K1Q8NGD4 311 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 GDAP1Q8TB36 358 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 HEXDCQ8WVB3 486 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 PIGBQ92521 554 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 PROX1Q92786 737 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 VMP1Q96GC9 406 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 HES6Q96HZ4 224 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF354BQ96LW1 612 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 PSD2Q9BQI7 771 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 DESI2Q9BSY9 194 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 PRRG4Q9BZD6 226 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 MIS12Q9H081 205 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 C2orf40Q9H1Z8 148 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 LMAN1LQ9HAT1 526 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 FAM118AQ9NWS6 357 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ERAP1Q9NZ08 941 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TXNDC16Q9P2K2 825 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 CACNG4Q9UBN1 327 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 KCNK7Q9Y2U2 307 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 DOCK7Q96N67 2140 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TRAV24A0A0B4J272 114 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 FAM172BPA6NC97 362 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD61A6NGH8 418 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 DUXAA6NLW8 204 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 H0YAE9 185 aa2.86□□□□□ -1.95
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PTPRC-205ENST00000391970 P2RY10O00398 339 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 DNM1LO00429 736 aa2.86□□□□□ -1.95
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PTPRC-205ENST00000391970 ARPC2O15144 300 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 SLC22A2O15244 555 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 STX6O43752 255 aa2.86□□□□□ -1.95
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PTPRC-205ENST00000391970 PGLSO95336 258 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 SPP1P10451 314 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ATP5DP30049 168 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 COPB2P35606 906 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 WNT5AP41221 380 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 RPL21P46778 160 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 MFAP3P55082 362 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 MTCP1P56278 107 aa2.86□□□□□ -1.95
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PTPRC-205ENST00000391970 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 KLC1Q07866 573 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TAF10Q12962 218 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 TNK1Q13470 666 aa2.86□□□□□ -1.95
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PTPRC-205ENST00000391970 PHKG1Q16816 387 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 MEP1BQ16820 701 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 FAM76BQ5HYJ3 339 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 NHSL2Q5HYW2 709 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 LRRC73Q5JTD7 316 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 NOTUMQ6P988 496 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 C19orf48Q6RUI8 117 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-205ENST00000391970 IL17RELQ6ZVW7 336 aa2.86□□□□□ -1.95
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