RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa25.99■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 TMEM198Q66K66 360 aa25.99■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 LPCAT2Q7L5N7 544 aa25.99■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 TMEM105Q8N8V8 129 aa25.99■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 C1orf216Q8TAB5 229 aa25.99■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 GPBAR1Q8TDU6 330 aa25.99■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 GSDMCQ9BYG8 508 aa25.99■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 MVB12BQ9H7P6 319 aa25.99■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 E7EQ34 232 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 PRAMEF4O60810 478 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 JUNDP17535 347 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 BLKP51451 505 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 CHIT1Q13231 466 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 WDR45BQ5MNZ6 344 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 IL27RAQ6UWB1 636 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 WASH2PQ6VEQ5 465 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 TAF8Q7Z7C8 310 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 CEP70Q8NHQ1 597 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 DNASE2BQ8WZ79 361 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 HBEGFQ99075 208 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 SGPP1Q9BX95 441 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 XKR8Q9H6D3 395 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 WASH6PQ9NQA3 447 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 POLG2Q9UHN1 485 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 IRF8Q02556 426 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 XKR6Q5GH73 641 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 LONP2Q86WA8 852 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 ACTRT2Q8TDY3 377 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 MARK4Q96L34 752 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 MENTQ9BUN1 341 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 SAR1AQ9NR31 198 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 TAAR2Q9P1P5 351 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 TRIM33Q9UPN9 1127 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 KCNE2Q9Y6J6 123 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 EML5Q05BV3 1969 aa25.98■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 CLGNO14967 610 aa25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 F3P13726 295 aa25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 ARHGAP19Q14CB8 494 aa25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 SPRED3Q2MJR0 410 aa25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 SGO1Q5FBB7 561 aa25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 PRRT3Q5FWE3 981 aa25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 STON2Q8WXE9 905 aa25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 GIMAP2Q9UG22 337 aa25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 ABCA7Q8IZY2 2146 aa25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa25.97■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 A6NCN8 305 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 ERGP11308 486 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 NPPBP16860 134 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 CYP2A13Q16696 494 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 GALNTL6Q49A17 601 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 METTL21CQ5VZV1 264 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 RAB42Q8N4Z0 105 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 OR52E1Q8NGJ3 308 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 NEIL2Q969S2 332 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 TUBGCP3Q96CW5 907 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 CATSPER2Q96P56 530 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 AKTIPQ9H8T0 292 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 SPATA7Q9P0W8 599 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 DYRK1BQ9Y463 629 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 LRP4O75096 1905 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 HSD17B2P37059 387 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 ABRAXAS2Q15018 415 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 L3MBTL4Q8NA19 623 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 SH3KBP1Q96B97 665 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 CXorf40BQ96DE9 158 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 LRRC61Q9BV99 259 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 ACAT2Q9BWD1 397 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 SH2B3Q9UQQ2 575 aa25.96■■□□□ 1.75
MSX1-201ENST00000382723 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 GNAZP19086 355 aa25.95■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 DOC2AQ14183 400 aa25.95■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 MIPEPQ99797 713 aa25.95■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 ZNF839A8K0R7 811 aa25.94■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 MANBAO00462 879 aa25.94■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 WFS1O76024 890 aa25.94■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 CSF2P04141 144 aa25.94■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 NXPH1P58417 271 aa25.94■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa25.94■■□□□ 1.74
MSX1-201ENST00000382723 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms