RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 CORINQ9Y5Q5 1042 aa24.65■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 GFRA2O00451 464 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 BCKDKO14874 412 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 TACR1P25103 407 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 HTR1BP28222 390 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 PTPN6P29350 595 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 RYKP34925 604 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 MLLT10P55197 1068 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 ABHD18Q0P651 414 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 SPCS2Q15005 226 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 DCDC5Q6ZRR9 648 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 TMEM150AQ86TG1 271 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 CCDC90BQ9GZT6 254 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 SNX6Q9UNH7 406 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf40-201ENST00000376854 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ITIH1P19827 911 aa24.64■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 NR4A1P22736 598 aa24.64■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 PPP3CCP48454 512 aa24.64■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 IL18R1Q13478 541 aa24.64■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 NR1D2Q14995 579 aa24.64■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa24.64■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CNIH3Q8TBE1 160 aa24.64■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 VNN3Q9NY84 501 aa24.64■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa24.64■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 XYLBO75191 536 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 INMTO95050 263 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 LRATO95237 230 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 SDC1P18827 310 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 PCMT1P22061 227 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CCR7P32248 378 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 IL5RAQ01344 420 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CDK5R2Q13319 367 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 AQP6Q13520 282 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 DOK6Q6PKX4 331 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 Q6ZNB5 142 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 FAM9CQ8IZT9 166 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 TESCQ96BS2 214 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 IGSF21Q96ID5 467 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 GPRC5BQ9NZH0 403 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ENPP5Q9UJA9 477 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 MITFO75030 526 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 IGSF6O95976 241 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CSNK1DP48730 415 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 PSMD7P51665 324 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CDKL4Q5MAI5 379 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CPZQ66K79 652 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 GALNT5Q7Z7M9 940 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CAPNS2Q96L46 248 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF510Q9Y2H8 683 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 DGKBQ9Y6T7 804 aa24.63■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 AGAP14A8MT82 685 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 PITPNM1O00562 1244 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 RFXANKO14593 260 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 DNAJB5O75953 348 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF682O95780 498 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CCDC159P0C7I6 412 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 OCM2P0CE71 109 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ITGAMP11215 1152 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 IGFBP5P24593 272 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 MAGEA2P43356 314 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 GP2P55259 537 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 RAPSNQ13702 412 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 TTC23LQ6PF05 361 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CRTC1Q6UUV9 634 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CENPSQ8N2Z9 138 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 COPS8Q99627 209 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CPQQ9Y646 472 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CFAP99D6REC4 459 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 XPNPEP2O43895 674 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CCNDBP1O95273 360 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 MAPK1P28482 360 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 SERPINA4P29622 427 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 SLC14A1Q13336 389 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 GGTA1PQ4G0N0 100 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 SLC22A15Q8IZD6 547 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 FBLIM1Q8WUP2 373 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ASIC4Q96FT7 647 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 CMTM7Q96FZ5 175 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 APIPQ96GX9 242 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 FBXO10Q9UK96 956 aa24.62■■□□□ 1.53
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms