RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376227.3

CCDC22-201, Transcript of coiled-coil domain containing 22, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC22, Length 2,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22-201ENST00000376227 LDLRAP1Q5SW96 308 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 OR2T29Q8NH02 315 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 RIBC2Q9H4K1 309 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 SERHLQ9NQF3 203 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ARL15Q9NXU5 204 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 AREL1O15033 823 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 XPNPEP2O43895 674 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 LATS1O95835 1130 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 PDYNP01213 254 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 IDUAP35475 653 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 RPIAP49247 311 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 IL1RL1Q01638 556 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 MVKQ03426 396 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 CDH18Q13634 790 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 GGTA1PQ4G0N0 100 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 RETSATQ6NUM9 610 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 SERPINA11Q86U17 422 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 NELL1Q92832 810 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 GLMNQ92990 594 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 GIN1Q9NXP7 522 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.8□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 SERPINB7O75635 380 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 GSNP06396 782 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 PRPH2P23942 346 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 GRK3P35626 688 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 NSG1P42857 185 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ST13P50502 369 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 NPTX1Q15818 432 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 GALNT5Q7Z7M9 940 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ADCK1Q86TW2 530 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 NXPE1Q8N323 547 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 TSSK3Q96PN8 268 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 MROQ9BYG7 248 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 EXD2Q9NVH0 621 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 STOML2Q9UJZ1 356 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 CPQQ9Y646 472 aa14.79□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 HOXA2O43364 376 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 SOCS5O75159 536 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 CLDN7O95471 211 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 GALTP07902 379 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ALOX5P09917 674 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ACPPP15309 386 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 BPIP17213 487 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 HIST1H2ADP20671 130 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 FPR1P21462 350 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 PTPN5P54829 565 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 PHC1P78364 1004 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ABRQ12979 859 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 OXA1LQ15070 435 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 CHRNA6Q15825 494 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 DOK6Q6PKX4 331 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ANKRD46Q86W74 232 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 HORMAD1Q86X24 394 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 TAMM41Q96BW9 452 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 HIST1H2AJQ99878 128 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 INPP5KQ9BT40 448 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 H2AFJQ9BTM1 129 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 TNKS2Q9H2K2 1166 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 DUSP21Q9H596 190 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.78□□□□□ -0.04
CCDC22-201ENST00000376227 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms