RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 TM9SF3Q9HD45 589 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 FLRT1Q9NZU1 646 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 WDR37Q9Y2I8 494 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 SSNA1O43805 119 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 STAT5AP42229 794 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 TUBA1BP68363 451 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 SCARB2Q14108 478 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CHRNA6Q15825 494 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 BICRALQ6AI39 1079 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CES5AQ6NT32 575 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 TUBA1AQ71U36 451 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 LAPTM4BQ86VI4 370 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 LGI4Q8N135 537 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 GKN1Q9NS71 199 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 ARMC1Q9NVT9 282 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CFL2Q9Y281 166 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 SEPT4O43236 478 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 BCAP31P51572 246 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 SH3BP2P78314 561 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CDKL1Q00532 357 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 GRIK2Q13002 908 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 DSC3Q14574 896 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 UPP1Q16831 310 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 HKDC1Q2TB90 917 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 C6orf141Q5SZD1 244 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 MFSD4BQ5TF39 518 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 LCN1P1Q5VSP4 162 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 TRNP1Q6NT89 227 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 RASSF5Q8WWW0 418 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 AP2M1Q96CW1 435 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 Q9Y3F1 56 aa17.02■□□□□ 0.32
PTPRU-202ENST00000373779 CHST10O43529 356 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 TPRG1LQ5T0D9 272 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 NPAS4Q8IUM7 802 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 BTN3A3O00478 584 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 PCDH7O60245 1069 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 DIRAS1O95057 198 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 CAPZA2P47755 286 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 VBP1P61758 197 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 OR4D1Q15615 310 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF730Q6ZMV8 503 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 USP30Q70CQ3 517 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 CRELD1Q96HD1 420 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 HSH2DQ96JZ2 352 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 CD244Q9BZW8 370 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 RHBGQ9H310 441 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 POFUT2Q9Y2G5 429 aa17.02■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 MAPK12P53778 367 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 SNTG1Q9NSN8 517 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 ADH1AP07327 375 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 ELNP15502 786 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 TCF3P15923 654 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 ARSDP51689 593 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 FBXO43Q4G163 708 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 KLHL35Q6PF15 583 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 CLDN19Q8N6F1 224 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 FERD3LQ96RJ6 166 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 A0A0J9YVX5 310 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 TBC1D3BA6NDS4 549 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 CBSLP0DN79 551 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 CBSP35520 551 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 CASP9P55211 416 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 OR2B6P58173 313 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 OR4D2P58180 307 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 GANABQ14697 944 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF534Q76KX8 674 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 ISCA2Q86U28 154 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 CFAP206Q8IYR0 622 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 TMIGD2Q96BF3 282 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 RMI1Q9H9A7 625 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 ANKHQ9HCJ1 492 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 NME6O75414 186 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 LAPTM4AQ15012 233 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 DDI2Q5TDH0 399 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 IKBIPQ70UQ0 350 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 FAM20CQ8IXL6 584 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 SCAIQ8N9R8 606 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 SP140LQ9H930 580 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 C3orf14Q9HBI5 128 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 CDC14AQ9UNH5 594 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 LSM1O15116 133 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 DYRK3O43781 588 aa17■□□□□ 0.31
PTPRU-202ENST00000373779 OR1I1O60431 355 aa17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms