RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 HTR3CQ8WXA8 447 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 ACOX2Q99424 681 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 VAT1Q99536 393 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 C12orf57Q99622 126 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 IL12RB2Q99665 862 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 C19orf43Q9BQ61 176 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 PPA2Q9H2U2 334 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 ATG2BQ96BY7 2078 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 TTC28Q96AY4 2481 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 J3KRW8 73 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 LINC01387J3KSC0 135 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 KCNK1O00180 336 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 TM9SF1O15321 606 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 KRT37O76014 449 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 APOL3O95236 402 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 SLC34A2O95436 690 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 POLBP06746 335 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 ITGAVP06756 1048 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 PRG2P13727 222 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 GNSP15586 552 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 ZNF23P17027 643 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 IL12RB1P42701 662 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 FNTBP49356 437 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 EPHB1P54762 984 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 PCDH1Q08174 1060 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CYP2A13Q16696 494 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 TEX44Q53QW1 395 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 EOGTQ5NDL2 527 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 TSPEARQ8WU66 669 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 GABRG3Q99928 467 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 NUDT15Q9NV35 164 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 SLC24A2Q9UI40 661 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 SNX6Q9UNH7 406 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 WASH3PC4AMC7 463 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CCDC188H7C350 402 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 ENTPD5O75356 428 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 PGM3O95394 542 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 JCHAINP01591 159 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 PTPN3P26045 913 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 HSD17B3P37058 310 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 SLC15A1P46059 708 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 GSTM5P46439 218 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CLCN5P51795 746 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 NEK3P51956 506 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 PYHIN1Q6K0P9 492 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 RGS9BPQ6ZS82 235 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 OR5H6Q8NGV6 325 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 WDR48Q8TAF3 677 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 PIK3R3Q92569 461 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 RTP4Q96DX8 246 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CHRDQ9H2X0 955 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CAPN10Q9HC96 672 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 GLS2Q9UI32 602 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.86□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 GSRP00390 522 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 EPHX1P07099 455 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 AOC1P19801 751 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CAPN3P20807 821 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 PRKCHP24723 683 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CHRNA3P32297 505 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 COILP38432 576 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 ALDH3B2P48448 385 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 CSNK1DP48730 415 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 RHOAP61586 193 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-201ENST00000351328 SCARB2Q14108 478 aa6.85□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms