RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TRADDQ15628 312 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB134Q4QY38 66 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SPANXN3Q5MJ09 141 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM215Q68D42 235 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DUPD1Q68J44 220 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC5A8Q8N695 610 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NPWQ8N729 165 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PPFIBP2Q8ND30 876 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OR1N1Q8NGS0 311 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP4.31□□□□□ -1.727e-7■■■■■ 32.6
PTPRC-201ENST00000348564 EPOP01588 193 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ACPPP15309 386 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GNAZP19086 355 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3R1P27986 724 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 HOXC12P31275 282 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PIK3CGP48736 1102 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DCDP81605 110 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 STX5Q13190 355 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 KCNAB1Q14722 419 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PTPRRQ15256 657 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GPR19Q15760 415 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 WASHC2DQ5SRD0 308 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ATAD3BQ5T9A4 648 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FAM45BPQ6NSW5 357 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ASB18Q6ZVZ8 466 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ABHD13Q7L211 337 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 HDXQ7Z353 690 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TMC3Q7Z5M5 1100 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CPLX4Q7Z7G2 160 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NUDCD3Q8IVD9 361 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FAM20CQ8IXL6 584 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FAM45AQ8TCE6 357 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NT5C3BQ969T7 300 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 HAUS8Q9BT25 410 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PARVBQ9HBI1 364 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 WASH6PQ9NQA3 447 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GPR83Q9NYM4 423 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 H3BNH8 94 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 K7ESF4 209 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GSTA4O15217 222 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NUAK1O60285 661 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ERN1O75460 977 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SPAG6O75602 509 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 STK16O75716 305 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINI2O75830 405 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 P04436 131 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SPTBP11277 2137 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TFEBP19484 476 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ME2P23368 584 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 HMGCLP35914 325 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MMP12P39900 470 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PRIM2P49643 509 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 STC1P52823 247 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RPP38P78345 283 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
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PTPRC-201ENST00000348564 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OLIG2Q13516 323 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GPR18Q14330 331 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 FZD2Q14332 565 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 BHLHA9Q7RTU4 235 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 SFRP1Q8N474 314 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PQLC3Q8N755 202 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 GPR26Q8NDV2 337 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 OR9A1PQ8NGU1 263 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 NCLNQ969V3 563 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ESAMQ96AP7 390 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TUBGCP3Q96CW5 907 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PEX11GQ96HA9 241 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TCF12Q99081 682 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CHST8Q9H2A9 424 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 METTL7AQ9H8H3 244 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CPNE5Q9HCH3 593 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 STMN3Q9NZ72 180 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 POU2F3Q9UKI9 436 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 DOCK6Q96HP0 2047 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 TANC1Q9C0D5 1861 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL33A6NCF5 533 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-201ENST00000348564 PRRG2O14669 202 aa4.31□□□□□ -1.72
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