RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 CALN1Q9BXU9 219 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SEMA4CQ9C0C4 833 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KLC2Q9H0B6 622 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 IL1RL2Q9HB29 575 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GID8Q9NWU2 228 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GDE1Q9NZC3 331 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 COPS7AQ9UBW8 275 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FAM153AQ9UHL3 310 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 AMFRQ9UKV5 643 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FZD10Q9ULW2 581 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SNX12Q9UMY4 172 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 VPS4AQ9UN37 437 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PSMD13Q9UNM6 376 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SH3GLB1Q9Y371 365 aa3.07□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 A0A088AWK7 358 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GSAPA4D1B5 854 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SHISA7A6NL88 538 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 C2CD4DB7Z1M9 353 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 E9PI62 339 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NPIPA5E9PKD4 350 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NPIPA3F8WFD2 350 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ARNTLO00327 626 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RAD51DO75771 328 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLC34A2O95436 690 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ATP6V1G2O95670 118 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LY86O95711 162 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LGI1O95970 557 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 AGTP01019 485 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 EPHB2P29323 1055 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLC1A1P43005 524 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLC9A3P48764 834 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 OXCT1P55809 520 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 COPS2P61201 443 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PPP2R2AP63151 447 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PHEXP78562 749 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TRAF2Q12933 501 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SP140Q13342 867 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GAB4Q2WGN9 574 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LRRC38Q5VT99 294 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ULK3Q6PHR2 472 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TPGS1Q6ZTW0 290 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ZSWIM9Q86XI8 627 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 C7orf57Q8NEG2 295 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 HDAC10Q969S8 669 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RGMAQ96B86 450 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MTERF3Q96E29 417 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 C7orf26Q96N11 449 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CSPG4P5Q96PW8 444 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 HAPLN3Q96S86 360 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MGME1Q9BQP7 344 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KIFC1Q9BW19 673 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NUDT9Q9BW91 350 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 EBF3Q9H4W6 596 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KCNK12Q9HB15 430 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SCPEP1Q9HB40 452 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GLOD4Q9HC38 313 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NEK6Q9HC98 313 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GALNT8Q9NY28 637 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 DNAJB11Q9UBS4 358 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NPIPA1Q9UND3 350 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TACC2O95359 2948 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ANKRD12Q6UB98 2062 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SEC16AO15027 2179 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 A0A087X0M5 115 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 A0A1B0GX30 115 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 B4E171 279 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 H0YIV9 168 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RNF13O43567 381 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SPDEFO95238 335 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TNFRSF6BO95407 300 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PLGP00747 810 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 IFNA16P05015 189 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FCER2P06734 321 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PPP3CBP16298 524 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PCGF2P35227 344 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RAB7AP51149 207 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KCNK10P57789 538 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RAB4BP61018 213 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LCP2Q13094 533 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SPIDRQ14159 915 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GRM2Q14416 872 aa3.06□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 OCLNQ16625 522 aa3.06□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms