RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 KIFC1Q9BW19 673 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 NPAP1Q9NZP6 1156 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 MGAT4AQ9UM21 535 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 MAFO75444 373 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 B3GALNT1O75752 331 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 NAT2P11245 290 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 DDOSTP39656 456 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 PNPLA4P41247 253 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 FCGRTP55899 365 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 FAPQ12884 760 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 IDO2Q6ZQW0 420 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 FGD2Q7Z6J4 655 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 TANKQ92844 425 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP16.25■□□□□ 0.196e-8■■■□□ 17.6
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PACS1-201ENST00000320580 DNAJC11Q9NVH1 559 aa16.25■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 SLC28A1O00337 649 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 OR10H3O60404 316 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 APOC3P02656 99 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 STOMP27105 288 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 FXNQ16595 210 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 SETD6Q8TBK2 473 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 M0R233 179 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 F8A1P23610 371 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 AKAP5P24588 427 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 FEN1P39748 380 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 STARP49675 285 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 ATP12AP54707 1039 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 LY6KQ17RY6 165 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 ZNF691Q5VV52 312 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 UBQLNLQ8IYU4 475 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 TRPM4Q8TD43 1214 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 RIPOR3Q96MK2 946 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 DPEP3Q9H4B8 488 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 IPPKQ9H8X2 491 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 GPR83Q9NYM4 423 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 ECM29Q5VYK3 1845 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 HMGCS1Q01581 520 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 TTLL4Q14679 1199 aa16.24■□□□□ 0.19
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PACS1-201ENST00000320580 TAZQ16635 292 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 DEF8Q6ZN54 512 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 MEIOBQ8N635 442 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 OR10G2Q8NGC3 310 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 SLC7A6Q92536 515 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 SLC39A13Q96H72 371 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 BEX1Q9HBH7 125 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 AIG1Q9NVV5 245 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 METTL15A6NJ78 407 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 SSTR4P31391 388 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 CYP4Z1Q86W10 505 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 FUNDC1Q8IVP5 155 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 BRD7Q9NPI1 651 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 MCUBQ9NWR8 336 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 EMC3Q9P0I2 261 aa16.24■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 APOL3O95236 402 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 INHBBP09529 407 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 CKMT1AP12532 417 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 GGT1P19440 569 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 NOVP48745 357 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 NPRL3Q12980 569 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 SIAH1Q8IUQ4 282 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 STK40Q8N2I9 435 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 GPR151Q8TDV0 419 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 GSRP00390 522 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 DSC3Q14574 896 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 CTF1Q16619 201 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 Q8N402 240 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 NEDD4LQ96PU5 975 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 FAM129BQ96TA1 746 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 C17orf62Q9BQA9 187 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 TTPALQ9BTX7 342 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 PPA2Q9H2U2 334 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 MS4A12Q9NXJ0 267 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 ERAP1Q9NZ08 941 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 HCN3Q9P1Z3 774 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 NFKBIEO00221 500 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 PPP6CO00743 305 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 UBL4AP11441 157 aa16.23■□□□□ 0.19
PACS1-201ENST00000320580 KIR3DL1P43629 444 aa16.23■□□□□ 0.19
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