RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269886.7

SH3GL1-201, Transcript of SH3 domain containing GRB2 like 1, endophilin A2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3GL1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1-201ENST00000269886 CBSLP0DN79 551 aa23.42■■□□□ 1.34
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SH3GL1-201ENST00000269886 CBSP35520 551 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3GL1-201ENST00000269886 MAPK8P45983 427 aa23.42■■□□□ 1.34
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SH3GL1-201ENST00000269886 HTR1BP28222 390 aa23.39■■□□□ 1.34
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SH3GL1-201ENST00000269886 CPZQ66K79 652 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3GL1-201ENST00000269886 CYP4Z1Q86W10 505 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3GL1-201ENST00000269886 P2RY13Q9BPV8 354 aa23.39■■□□□ 1.34
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