RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 SPATA9Q9BWV2 254 aa21.4■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 IFT46Q9NQC8 304 aa21.4■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.4■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 EVA1BQ9NVM1 165 aa21.4■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 HSPB11Q9Y547 144 aa21.4■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 G3V2T6 193 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 RGS5O15539 181 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 TULP3O75386 442 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 TP53P04637 393 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 CLEC2LP0C7M8 214 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 CCNYL3P0C7X3 344 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 NCK1P16333 377 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 NR2C2P49116 596 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 CXCR4P61073 352 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 ERVK-21P61565 698 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 KCNC3Q14003 757 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 CACHD1Q5VU97 1274 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 PHC2Q8IXK0 858 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 SLC22A8Q8TCC7 542 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 NXPE3Q969Y0 559 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 TMEM125Q96AQ2 219 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 LRRC58Q96CX6 371 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 TRIM54Q9BYV2 358 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 ERVK13-1Q9NX77 482 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 BFARQ9NZS9 450 aa21.39■■□□□ 1.02
PITX1-201ENST00000265340 TET1Q8NFU7 2136 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 TFECO14948 347 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 SLC16A6O15403 523 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 SULT1B1O43704 296 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 FADS2O95864 444 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 POLBP06746 335 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 SELPP16109 830 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 CSRP3P50461 194 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 ZMYND11Q15326 602 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 CNSTQ6PJW8 725 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 SYVN1Q86TM6 617 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 PROSER1Q86XN7 944 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 RDH10Q8IZV5 341 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 OR8H1Q8NGG4 311 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 CNIH3Q8TBE1 160 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 SMURF2Q9HAU4 748 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 SCN3BQ9NY72 215 aa21.39■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 A0A0J9YYE9 177 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 OLFM2O95897 454 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 MYL9P24844 172 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 ADRA1BP35368 520 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 TIE1P35590 1138 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 OVOS1Q6IE37 1185 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 NECAB2Q7Z6G3 386 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 ITPAQ9BY32 194 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 SPNS1Q9H2V7 528 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 RGS18Q9NS28 235 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 CCDC182A6NF36 153 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 F5H423 210 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 LINC01387J3KSC0 135 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 NR5A2O00482 541 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 NBNO60934 754 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 PIK3CBP42338 1070 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 TPMTP51580 245 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 METTL23Q86XA0 190 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 SLC30A2Q9BRI3 323 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 MMP28Q9H239 520 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 C3orf18Q9UK00 162 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 TTC3P53804 2025 aa21.38■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 NLRC5Q86WI3 1866 aa21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 RGS10O43665 173 aa21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 TLL1O43897 1013 aa21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 GPNMBQ14956 572 aa21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 COQ5Q5HYK3 327 aa21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 ADGRG3Q86Y34 549 aa21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 RASGRP3Q8IV61 690 aa21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 VWA5B2Q8N398 1253 aa21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 PDXPQ96GD0 296 aa21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 SUSD3Q96L08 255 aa21.37■■□□□ 1.01
PITX1-201ENST00000265340 DDIT4Q9NX09 232 aa21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms