RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 GANCQ8TET4 914 aa6.89□□□□□ -1.31
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SMARCE1-201ENST00000264640 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PHF21BQ96EK2 531 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP1R36Q96LQ0 422 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 HAUS8Q9BT25 410 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 DERL2Q9GZP9 239 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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SMARCE1-201ENST00000264640 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 THSD1Q9NS62 852 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 NDFIP2Q9NV92 336 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ELOVL2Q9NXB9 296 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF112Q9ULX5 631 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PADI4Q9UM07 663 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SATB2Q9UPW6 733 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 RP1P56715 2156 aa6.89□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1W2PPC4 97 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 BLACEA4D250 179 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ENO4A6NNW6 628 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 H3BNX3 289 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 STX16O14662 325 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 INSIG1O15503 277 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 FFAR2O15552 330 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LDB2O43679 373 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 KDELR3O43731 214 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CNTN5O94779 1100 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MATN4O95460 622 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MLYCDO95822 493 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC4A1P02730 911 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 DNTTP04053 509 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 C8BP07358 591 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 RHOCP08134 193 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP2P08253 660 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 HMBSP08397 361 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 FCGR1AP12314 374 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 IDO1P14902 403 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CD1DP15813 335 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PCSK2P16519 638 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LBPP18428 481 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGB6P18564 788 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 IL10P22301 178 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PEX2P28328 305 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CD38P28907 300 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC7A1P30825 629 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LSSP48449 732 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SUOXP51687 545 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 AQP4P55087 323 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 MAXP61244 160 aa6.88□□□□□ -1.31
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SMARCE1-201ENST00000264640 GNA12Q03113 381 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LCP2Q13094 533 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CLN3Q13286 438 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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SMARCE1-201ENST00000264640 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 TYSND1Q2T9J0 566 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LIN52Q52LA3 116 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 SFT2D3Q587I9 215 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 LPCAT4Q643R3 524 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 REP15Q6BDI9 236 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 GK5Q6ZS86 529 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 AHI1Q8N157 1196 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.88□□□□□ -1.31
SMARCE1-201ENST00000264640 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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