RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259154.8

KCTD3-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD3, Length 3,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3-201ENST00000259154 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.53□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 RNF180Q86T96 592 aa14.53□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.53□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 PTERQ96BW5 349 aa14.53□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 ALDH3B2P48448 385 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 SLC11A2P49281 568 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 EMP3P54852 163 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 DSC3Q14574 896 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 CYBRD1Q53TN4 286 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 STEAP4Q687X5 459 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 WDR90Q96KV7 1748 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 ALDH1A2O94788 518 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 C1QAP02745 245 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 PGRP06401 933 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 C8BP07358 591 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 ANXA5P08758 320 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 SELPLGQ14242 412 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 XKR6Q5GH73 641 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 BORAQ6PGQ7 559 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 BHLHB9Q6PI77 547 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 SYVN1Q86TM6 617 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 ARMC5Q96C12 935 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 MSANTD3Q96H12 275 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 MCUBQ9NWR8 336 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 C1orf109Q9NX04 203 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 GPSM3Q9Y4H4 160 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.52□□□□□ -0.08
KCTD3-201ENST00000259154 ANK1P16157 1881 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 PRAMEF10O60809 474 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 GSTM5P46439 218 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 KLHL12Q53G59 568 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 ALFQ53S48 1182 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 RELTQ969Z4 430 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 WACQ9BTA9 647 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 TEX12Q9BXU0 123 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 OR51E2Q9H255 320 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 MAT2BQ9NZL9 334 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 USP34Q70CQ2 3546 aa14.52□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 DPYSL4O14531 572 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 CTDSP2O14595 271 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 MTX2O75431 263 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 CCNCP24863 283 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 BTBD16Q32M84 506 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 PLEKHG6Q3KR16 790 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 USP30Q70CQ3 517 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 OR2T29Q8NH02 315 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 CHPT1Q8WUD6 406 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 PKP4Q99569 1192 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 NEURL2Q9BR09 285 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 DYRK3O43781 588 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 HOXD10P28358 340 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 KCNC1P48547 511 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 MAPK12P53778 367 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 PFKPQ01813 784 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 PTSQ03393 145 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 KIFC1Q9BW19 673 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 ITPAQ9BY32 194 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 FAM105AQ9NUU6 356 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 TRPV2Q9Y5S1 764 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 SGTAO43765 313 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 TRBC1P01850 177 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 MAPK1P28482 360 aa14.51□□□□□ -0.09
KCTD3-201ENST00000259154 TTPAP49638 278 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms