RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 SUPT3HB4E1H0 165 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 G3V2L1 256 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 KDM1AO60341 852 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 SUPT3HO75486 399 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 UBXN7O94888 489 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 GUCA1CO95843 209 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 AMD1P17707 334 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 WDR4P57081 412 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CCDC63Q8NA47 563 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 PDPRQ8NCN5 879 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 OR52E1Q8NGJ3 308 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CKAP2Q8WWK9 683 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 MENTQ9BUN1 341 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 EPN3Q9H201 632 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 MLXIPLQ9NP71 852 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CD274Q9NZQ7 290 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CIDEBQ9UHD4 219 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 MID2Q9UJV3 735 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 TMCO1Q9UM00 188 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 GMNCA6NCL1 334 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CASC3O15234 703 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 PROS1P07225 676 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 ANXA5P08758 320 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 DHRS4L1P0CG22 281 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 TAC1P20366 129 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 NKAIN2Q5VXU1 208 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 ZYG11AQ6WRX3 759 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 MAGEB18Q96M61 343 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 EGFL8Q99944 293 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 SPATA7Q9P0W8 599 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 COPG2Q9UBF2 871 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 PLAGL1Q9UM63 463 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 DCHS1Q96JQ0 3298 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 D6RAR5 112 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 DLX3O60479 287 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM24O75264 130 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CPNE6O95741 557 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 S100BP04271 92 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 MYL2P10916 166 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 ERGP11308 486 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CPA3P15088 417 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 TYRP1P17643 537 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CD1CP29017 333 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CLDN6P56747 220 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 FOXC1Q12948 553 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 PCLAFQ15004 111 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 SULT1C3Q6IMI6 304 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 KLHL35Q6PF15 583 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 USP53Q70EK8 1073 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 GALNT15Q8N3T1 639 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 FBXO39Q8N4B4 442 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 LCN9Q8WX39 176 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 NCSTNQ92542 709 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 RHBDF1Q96CC6 855 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 FBXL8Q96CD0 374 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CHMP6Q96FZ7 201 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 PTPRBP23467 1997 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 KNTC1P50748 2209 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 A8MT66 165 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 SLC16A8O95907 504 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 MT-CO3P00414 261 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 GFAPP14136 432 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 IMPA1P29218 277 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 HNMTP50135 292 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 NFKB2Q00653 900 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 ARHGAP19Q14CB8 494 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 TMPRSS12Q86WS5 348 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 TCAIMQ8N3R3 496 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF480Q8WV37 535 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 ATL1Q8WXF7 558 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 DEPDC7Q96QD5 511 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 DPYSL5Q9BPU6 564 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 SRMSQ9H3Y6 488 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 ICKQ9UPZ9 632 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CLCA2Q9UQC9 943 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 TAPBPO15533 448 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 JUPP14923 745 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 PKLRP30613 574 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 HSD17B2P37059 387 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 CAPZBP47756 277 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 SERPINB4P48594 390 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 RAB28P51157 221 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXD11-201ENST00000249504 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms