RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 OR7A2PQ8NGA2 310 aa24.88■■□□□ 1.57
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RAB40C-201ENST00000248139 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa24.88■■□□□ 1.57
RAB40C-201ENST00000248139 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
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RAB40C-201ENST00000248139 CORINQ9Y5Q5 1042 aa24.88■■□□□ 1.57
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RAB40C-201ENST00000248139 SH3GL1Q99961 368 aa24.86■■□□□ 1.57
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RAB40C-201ENST00000248139 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa24.85■■□□□ 1.57
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RAB40C-201ENST00000248139 ARL10Q8N8L6 244 aa24.85■■□□□ 1.57
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RAB40C-201ENST00000248139 FMO3P31513 532 aa24.84■■□□□ 1.57
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RAB40C-201ENST00000248139 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa24.84■■□□□ 1.57
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa24.84■■□□□ 1.57
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RAB40C-201ENST00000248139 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
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RAB40C-201ENST00000248139 C16orf96A6NNT2 1141 aa24.84■■□□□ 1.57
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RAB40C-201ENST00000248139 ATG9BQ674R7 924 aa24.84■■□□□ 1.57
RAB40C-201ENST00000248139 CLECL1Q8IZS7 167 aa24.84■■□□□ 1.57
RAB40C-201ENST00000248139 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
RAB40C-201ENST00000248139 SLC15A4Q8N697 577 aa24.84■■□□□ 1.57
RAB40C-201ENST00000248139 OR5K1Q8NHB7 308 aa24.84■■□□□ 1.57
RAB40C-201ENST00000248139 SUV39H2Q9H5I1 410 aa24.84■■□□□ 1.57
RAB40C-201ENST00000248139 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa24.83■■□□□ 1.57
RAB40C-201ENST00000248139 A0A096LPI6 279 aa24.83■■□□□ 1.57
RAB40C-201ENST00000248139 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
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