RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 WNT1P04628 370 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ENO1P06733 434 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPN1P07384 714 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 MAOBP27338 520 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC121Q6ZUS5 278 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 IQCHQ86VS3 1027 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 NRROSQ86YC3 692 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf216Q8TAB5 229 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 C19orf60Q96EN9 201 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 MED8Q96G25 268 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 FERD3LQ96RJ6 166 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TRPS1Q9UHF7 1281 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TECTAO75443 2155 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 E7ENX8 843 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 PIP5K1BO14986 540 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ERGP11308 486 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 HGFP14210 728 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 PNLIPRP1P54315 467 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TAP2Q03519 686 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKG2Q13237 762 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 RPE65Q16518 533 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNTL6Q49A17 601 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 SPDYAQ5MJ70 313 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 SYTL1Q8IYJ3 562 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEFF1Q8IYR6 380 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 RGL4Q8IZJ4 473 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 METTL6Q8TCB7 284 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTRT2Q8TDY3 377 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4K3Q96R72 315 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 MENTQ9BUN1 341 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 KLF15Q9UIH9 416 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 VCANP13611 3396 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 UBOX5O94941 541 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CLDN9O95484 217 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CHEK2O96017 543 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTR1BP42025 376 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTR1AP61163 376 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TBPL1P62380 186 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP19Q14CB8 494 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 PARGQ86W56 976 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP70Q8NHQ1 597 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 GPBAR1Q8TDU6 330 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 DNASE2BQ8WZ79 361 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf30Q96M34 536 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 SGPP1Q9BX95 441 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 MVB12BQ9H7P6 319 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 TM9SF3Q9HD45 589 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 PLAGL1Q9UM63 463 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF11Q9Y3C5 154 aa24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1-215ENST00000628018 A6NCN8 305 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52A4PA6NMU1 304 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 EML2O95834 649 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 HSD17B2P37059 387 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 HALP42357 657 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 FNTBP49356 437 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDH1Q08174 1060 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 GGTA1PQ4G0N0 100 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM91A1Q658Y4 838 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC30A9Q6PML9 568 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR5BQ86VZ2 330 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 IL17FQ96PD4 163 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTR8Q9H981 624 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 SAR1AQ9NR31 198 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA7Q9P0W8 599 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 POLG2Q9UHN1 485 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 BTRCQ9Y297 605 aa24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM221A6NGB7 291 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 E9PBE3 544 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 M0R296 226 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL41O60662 606 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF4O60810 478 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TCEA2Q15560 299 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP2A13Q16696 494 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.455e-7■■■□□ 15.7
CAPNS1-215ENST00000628018 HOMEZQ8IX15 550 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 DDIASQ8IXT1 998 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 L3MBTL4Q8NA19 623 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CAMK1GQ96NX5 476 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CCT7Q99832 543 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1-215ENST00000628018 CAAP1Q9H8G2 361 aa24.13■■□□□ 1.45
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