RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 GFAPP14136 432 aa8.26□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 TAC1P20366 129 aa8.26□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 ALDH4A1P30038 563 aa8.26□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 PKLRP30613 574 aa8.26□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 HPDP32754 393 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 SHMT2P34897 504 aa8.26□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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SGMS1-211ENST00000626236 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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SGMS1-211ENST00000626236 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 GRB7Q14451 532 aa8.26□□□□□ -1.09
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SGMS1-211ENST00000626236 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 TAX1BP1Q86VP1 789 aa8.26□□□□□ -1.09
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SGMS1-211ENST00000626236 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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SGMS1-211ENST00000626236 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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SGMS1-211ENST00000626236 OR10G6Q8NH81 332 aa8.25□□□□□ -1.09
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SGMS1-211ENST00000626236 FBXL8Q96CD0 374 aa8.25□□□□□ -1.09
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SGMS1-211ENST00000626236 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC3Q9BQI4 270 aa8.25□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 MENTQ9BUN1 341 aa8.25□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.25□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa8.25□□□□□ -1.09
SGMS1-211ENST00000626236 MED4Q9NPJ6 270 aa8.25□□□□□ -1.09
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