RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614136.1

SRSF3-205, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 3, human

Gene SRSF3, Length 2,376 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRSF3-205	ENST00000614136	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PCM1	Q15154	2024 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136		A6NNZ2	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SYCE1L	A8MT33	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TLR4	O00206	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TRIM13	O60858	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SUPT3H	O75486	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SUPT7L	O94864	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CBSL	P0DN79	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	KIT	P10721	976 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	MTHFD2	P13995	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TAC1	P20366	129 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TEAD1	P28347	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	HOXA6	P31267	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	LSP1	P33241	339 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CBS	P35520	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	GDF5	P43026	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CLCNKA	P51800	687 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	HK3	P52790	923 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TNP2	Q05952	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PRKG2	Q13237	762 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	C1orf61	Q13536	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PCLAF	Q15004	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PDK4	Q16654	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PHKG1	Q16816	387 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	BCL7A	Q4VC05	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CFAP157	Q5JU67	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SBSN	Q6UWP8	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	LPCAT2	Q7L5N7	544 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	FBXL6	Q8N531	539 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	AGR3	Q8TD06	166 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	EGFL8	Q99944	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CD274	Q9NZQ7	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ASF1A	Q9Y294	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	OR52A4P	A6NMU1	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	GFY	I3L273	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	BIRC5	O15392	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	FFAR2	O15552	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	KERA	O60938	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	SMIM24	O75264	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	MATN4	O95460	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	BPNT1	O95861	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TNF	P01375	233 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	CTSE	P14091	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	VCL	P18206	1134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	TSPAN8	P19075	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRSF3-205	ENST00000614136	IMPDH1	P20839	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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