RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 PADI2Q9Y2J8 665 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PRKAB1Q9Y478 270 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.32□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 A0A0J9YVX5 310 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 INAFM1C9JVW0 142 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PEX12O00623 359 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ZWINTO95229 277 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SERPING1P05155 500 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ACP5P13686 325 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PORP16435 677 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 TNFAIP3P21580 790 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SERPINA4P29622 427 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PRCPP42785 496 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SULT1E1P49888 294 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CLCNKAP51800 687 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CASP6P55212 293 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 RBPJQ06330 500 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 BCL2A1Q16548 175 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PTCHD3Q3KNS1 767 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 WDTC1Q8N5D0 677 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 MS4A14Q96JA4 679 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 NSMCE3Q96MG7 304 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SERPINB12Q96P63 405 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 AGAP4Q96P64 663 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 TBCBQ99426 244 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CGREF1Q99674 301 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 NDC1Q9BTX1 674 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 EPS8L2Q9H6S3 715 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PDFQ9HBH1 243 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 GPAMQ9HCL2 828 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 FAIMQ9NVQ4 179 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 TFR2Q9UP52 801 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.31□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SPTBP11277 2137 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 F8W8V4 182 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SMAPO00193 183 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PSMD11O00231 422 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SNX2O60749 519 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PALMO75781 387 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 WISP2O76076 250 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ERBB2P04626 1255 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DNASE1P24855 282 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CXCR5P32302 372 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SPAM1P38567 509 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CSNK1DP48730 415 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SLC18A1P54219 525 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 Q6ZVL8 140 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 TMEM151BQ8IW70 566 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 KIF2BQ8N4N8 673 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PHC3Q8NDX5 983 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 MAP3K3Q99759 626 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 OCEL1Q9H607 264 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SYNCQ9H7C4 482 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SLC6A20Q9NP91 592 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 POT1Q9NUX5 634 aa11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 TMEM247A6NEH6 219 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 C9J4A7 227 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 LDB2O43679 373 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ASMTLO95671 621 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 UMODP07911 640 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 MSX1P28360 303 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 VIPR1P32241 457 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 GPR1P46091 355 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ADARP55265 1226 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 HSD11B2P80365 405 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 GPR18Q14330 331 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CCDC153Q494R4 210 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 VWA3BQ502W6 1294 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CFAP157Q5JU67 520 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CES4AQ5XG92 561 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DUPD1Q68J44 220 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 CAMKMTQ7Z624 323 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 ARHGAP24Q8N264 748 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 LZTR1Q8N653 840 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DMRTA2Q96SC8 542 aa11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
HCG18-241ENST00000602290 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms