RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-223ENST00000592576 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 XKR8Q9H6D3 395 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 TMCO1Q9UM00 188 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 LNP1A1A4G5 178 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 DLL1O00548 723 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 NOBOXO60393 691 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 CER1O95813 267 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 TSPAN8P19075 237 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 GGT5P36269 586 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 HHEXQ03014 270 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 NAE1Q13564 534 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 GPR18Q14330 331 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ATG14Q6ZNE5 492 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ATL1Q8WXF7 558 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 MED8Q96G25 268 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 CD244Q9BZW8 370 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 C20orf27Q9GZN8 174 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 POT1Q9NUX5 634 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ASXL3Q9C0F0 2248 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ERICH4A6NGS2 130 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 TCP11X1B4DZS4 312 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 E7ENX8 843 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 E2F3O00716 465 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 STK16O75716 305 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 CCT8P50990 548 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 RAB28P51157 221 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 PNLIPRP1P54315 467 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 TAP2Q03519 686 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ASPHQ12797 758 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 STX3Q13277 289 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 27.4
EFTUD2-223ENST00000592576 ANKS6Q68DC2 871 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ARL14Q8N4G2 192 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 MAPK15Q8TD08 544 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 PPP4R1Q8TF05 950 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ABCF3Q9NUQ8 709 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 PCTPQ9UKL6 214 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 PPP6CO00743 305 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ITM2AO43736 263 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 GRK2P25098 689 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 LSP1P33241 339 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 SLC6A12P48065 614 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 GNGT1P63211 74 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 SUSD1Q6UWL2 747 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 LINC01555Q8NAE3 123 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 KYQ8NBH2 561 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 OR4E2Q8NGC2 313 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 UBTD2Q8WUN7 234 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 LCN9Q8WX39 176 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 PITPNM3Q9BZ71 974 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 GSTO2Q9H4Y5 243 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 CCDC134Q9H6E4 229 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ZBTB26Q9HCK0 441 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 OPTCQ9UBM4 332 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ICKQ9UPZ9 632 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.88□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 TRIM38O00635 465 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 KLF11O14901 512 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 YKT6O15498 198 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 WDR47O94967 919 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 CHRNGP07510 517 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ERGP11308 486 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 FASLGP48023 281 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 SLC1A6P48664 564 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 TBPL1P62380 186 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 PLCL1Q15111 1095 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 ATG16L1Q676U5 607 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 RGS9BPQ6ZS82 235 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 SLC35F3Q8IY50 421 aa8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
EFTUD2-223ENST00000592576 TEX9Q8N6V9 391 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms