RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC23Q9UJX2 597 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 GDF10P55107 478 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC38Q502W7 563 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QL3Q5VWW1 255 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 IGFL2Q6UWQ7 119 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 OVCH1Q7RTY7 1134 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC170Q8IYT3 715 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 DLG3Q92796 817 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 NACC2Q96BF6 587 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CIDEBQ9UHD4 219 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP10Q9Y6W6 482 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA1DQ01668 2161 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 OR56A5P0C7T3 313 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 MCM3P25205 808 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 RAB28P51157 221 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 NKG7Q16617 165 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 VRK3Q8IV63 474 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 GRHL3Q8TE85 626 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 IL17FQ96PD4 163 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR54Q9H977 334 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PCM1Q15154 2024 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC88CQ9P219 2028 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 KDM1AO60341 852 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ONECUT2O95948 504 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PTMSP20962 102 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CCR7P32248 378 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ARSFP54793 590 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 KIRREL2Q6UWL6 708 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 TAX1BP1Q86VP1 789 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC22A15Q8IZD6 547 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 OR13J1Q8NGT2 312 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC26A1Q9H2B4 701 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CTSFQ9UBX1 484 aa24.6■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 ALBP02768 609 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CETN2P41208 172 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIA3P42263 894 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 TSFMP43897 325 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 GRB7Q14451 532 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 P3H1Q32P28 736 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 FCRL6Q6DN72 434 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52K1Q8NGK4 314 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJB14Q8TBM8 379 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 AGAP4Q96P64 663 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPY26PQ9H489 355 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CUTCQ9NTM9 273 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 OSGIN2Q9Y236 505 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CELSR2Q9HCU4 2923 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CREBBPQ92793 2442 aa24.59■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CROCCQ5TZA2 2017 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 DSCR3O14972 297 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRTM2O43300 516 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 GOT2P00505 430 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CD9P21926 228 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA14Q0VDF9 509 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 PARP9Q8IXQ6 854 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 DTWD1Q8N5C7 304 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CNDP1Q96KN2 507 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 MESP1Q9BRJ9 268 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM121Q9BTD3 319 aa24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
CAPNS1-211ENST00000590874 NUP210LQ5VU65 1888 aa24.58■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFRSF8P28908 595 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 Q0VFX4 171 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC16Q13042 620 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBB8Q3ZCM7 444 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CFAP61Q8NHU2 1237 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND1AQ8TEH3 1009 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 HDAC10Q969S8 669 aa24.57■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 GRID2IPA4D2P6 1211 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCF5A8MTL0 148 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMD3O43242 534 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 GPC4O75487 556 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 S1PR4O95977 384 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1D4P47884 311 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 SEMA3AQ14563 771 aa24.56■■□□□ 1.52
CAPNS1-211ENST00000590874 GRM7Q14831 915 aa24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms