RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589759.1

ATP6V0A1-223, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 3

Gene ATP6V0A1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HK1	P19367	917 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KCNA5	P22460	613 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GADD45A	P24522	165 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PTAFR	P25105	342 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HTR1E	P28566	365 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TNFSF8	P32971	234 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TGFBR1	P36897	503 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GCLM	P48507	274 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	POU3F4	P49335	361 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ARFIP1	P53367	373 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	EPHA4	P54764	986 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	WNT7B	P56706	349 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CLDN20	P56880	219 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RAB4B	P61018	213 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CSNK2B	P67870	215 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ACY1	Q03154	408 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HSF2	Q03933	536 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PUDP	Q08623	228 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DUSP4	Q13115	394 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KCNAB2	Q13303	367 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KEAP1	Q14145	624 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KCNAB1	Q14722	419 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF79	Q15937	498 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TATDN3	Q17R31	274 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PLET1	Q6UQ28	207 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RTL4	Q6ZR62	310 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF534	Q76KX8	674 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CEP68	Q76N32	757 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KRT74	Q7RTS7	529 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MIB1	Q86YT6	1006 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	HGD	Q93099	445 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FATE1	Q969F0	183 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RBP7	Q96R05	134 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	FIZ1	Q96SL8	496 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CGRRF1	Q99675	332 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CMTM6	Q9NX76	183 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MLX	Q9UH92	298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	CSAD	Q9Y600	493 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	MYLK	Q15746	1914 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759		A0A0G2JMZ2	1700 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-223	ENST00000589759	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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