RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 WDR70Q9NW82 654 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 TMEM9Q9P0T7 183 aa9.6□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 PDP2Q9P2J9 529 aa9.6□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 C9orf172C9J069 976 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 GFYI3L273 518 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 K7ENP7 123 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 PRAMEF10O60809 474 aa9.59□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 C1orf105O95561 183 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 TSPAN12O95859 305 aa9.59□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 C8GP07360 202 aa9.59□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 STMN1P16949 149 aa9.59□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 TAS2R39P59534 338 aa9.59□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 RAB10P61026 200 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 KRT33BQ14525 404 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 SLC29A2Q14542 456 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.872e-7■□□□□ 9.8
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GGA3-209ENST00000580646 TGIF1Q15583 401 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 TTC23LQ6PF05 361 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 PAQR3Q6TCH7 311 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-209ENST00000580646 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.59□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 CARFQ8N187 725 aa9.59□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.59□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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GGA3-209ENST00000580646 CCDC189A1A4V9 331 aa9.58□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 A8MU76 341 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 MYO1CO00159 1063 aa9.58□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 ZBTB14O43829 449 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 PIAS1O75925 651 aa9.58□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 C9P02748 559 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 NUDT17P0C025 328 aa9.58□□□□□ -0.88
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GGA3-209ENST00000580646 CRABP2P29373 138 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 HSD17B2P37059 387 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 MSH2P43246 934 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 RAB28P51157 221 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 RHDQ02161 417 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 GRB7Q14451 532 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-209ENST00000580646 PLCL1Q15111 1095 aa9.58□□□□□ -0.88
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