RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 PTPRBP23467 1997 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 KRT87PA6NCN2 255 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF839A8K0R7 811 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 A8MT66 165 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 G3V2L1 256 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SLC16A8O95907 504 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SBK3P0C264 359 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 FTH1P19P0C7X4 201 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CKMT1AP12532 417 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 MTHFD2P13995 350 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CPA3P15088 417 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ACP1P24666 158 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SHMT2P34897 504 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 HSD17B2P37059 387 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ETV4P43268 484 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 KCNC1P48547 511 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ACADVLP49748 655 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 MAZP56270 477 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 NFKB2Q00653 900 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ASPHQ12797 758 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 GPR18Q14330 331 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 GRB7Q14451 532 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ARHGAP19Q14CB8 494 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 NR0B2Q15466 257 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PFKFB4Q16877 469 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CCDC157Q569K6 752 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CDKL4Q5MAI5 379 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 HHATQ5VTY9 493 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SULT1C3Q6IMI6 304 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 GUSBP11Q6P575 273 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SYTL1Q8IYJ3 562 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 TCAIMQ8N3R3 496 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ARL14Q8N4G2 192 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PDPRQ8NCN5 879 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 LCN9Q8WX39 176 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 FBXL8Q96CD0 374 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PKP4Q99569 1192 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 WWOXQ9NZC7 414 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SPATA7Q9P0W8 599 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CIDEBQ9UHD4 219 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PADI4Q9UM07 663 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PIEZO1Q92508 2521 aa6.5□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CEP250Q9BV73 2442 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CPED1A4D0V7 1026 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 LILRA5A6NI73 299 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 RHPN2P1A8MT19 583 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 STX16O14662 325 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CASC3O15234 703 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PPM1DO15297 605 aa6.49□□□□□ -1.37
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PRPF8-210ENST00000574217 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 KLK8O60259 260 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 DLX3O60479 287 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 RFPL3O75679 317 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 DKK1O94907 266 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 BPGMP07738 259 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ERGP11308 486 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 NEFHP12036 1026 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CHN1P15882 459 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 GLB1P16278 677 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 CCND1P24385 295 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 IMPA1P29218 277 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 PKLRP30613 574 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 SERPINB4P48594 390 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 ATP1A2P50993 1020 aa6.49□□□□□ -1.37
PRPF8-210ENST00000574217 RAB28P51157 221 aa6.49□□□□□ -1.37
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