RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	LIN7A	O14910	233 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TAPBP	O15533	448 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SH3BP5	O60239	455 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ATP5H	O75947	161 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FSBP	O95073	299 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	UNC5C	O95185	931 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MATN4	O95460	622 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GUCA1C	O95843	209 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SYP	P08247	313 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	FGF4	P08620	206 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ACADM	P11310	421 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CYP2A7	P20853	494 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ITPKA	P23677	461 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	EPHA3	P29320	983 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	HOXD12	P35452	270 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TRIM23	P36406	574 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MAPK9	P45984	424 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PREP	P48147	710 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	INHBC	P55103	352 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PKNOX1	P55347	436 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	LSM11	P83369	360 aa	Known RBP eCLIP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CDK3	Q00526	305 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	BTK	Q06187	659 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SGCG	Q13326	291 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TBCC	Q15814	346 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	RBBP7	Q16576	425 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KANK2	Q63ZY3	851 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NEK5	Q6P3R8	708 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	XKR5	Q6UX68	686 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ACAD11	Q709F0	780 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NAXD	Q8IW45	347 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PGBD3	Q8N328	593 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OXR1	Q8N573	874 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	HM13	Q8TCT9	377 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	RLN3	Q8WXF3	142 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ASB12	Q8WXK4	309 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM159	Q96B96	161 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	OR52B2	Q96RD2	323 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ZNF382	Q96SR6	550 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	EGFL8	Q99944	293 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CD244	Q9BZW8	370 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	WDR26	Q9H7D7	661 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CAPN10	Q9HC96	672 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	WWOX	Q9NZC7	414 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ARMCX1	Q9P291	453 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GULP1	Q9UBP9	304 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GPR34	Q9UPC5	381 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	PDE10A	Q9Y233	779 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	KNTC1	P50748	2209 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395		A0A1B0GTL3	188 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	C17orf113	A0A1B0GUU1	675 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395		E9PBE3	544 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TPM1-231	ENST00000561395		K7EPI3	171 aa		7.32	□□□□□ -1.24

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