RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRRT4C9JH25 899 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 GSRP00390 522 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 C1QAP02745 245 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 MT-ND3P03897 115 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 UGT2B4P06133 528 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 ALPIP09923 528 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 CISD3P0C7P0 127 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 ALADP13716 330 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 HLA-EP13747 358 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 BRAFP15056 766 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSMC3P17980 439 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 SAT1P21673 171 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCNA5P22460 613 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC6A2P23975 617 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 SERPINA4P29622 427 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 NNMTP40261 264 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 RGS19P49795 217 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 GNGT1P63211 74 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRAMEP78395 509 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 HSD11B2P80365 405 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 MPP1Q00013 466 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC20A2Q08357 652 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNGA3Q16281 694 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 CYP2A13Q16696 494 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYLK3Q32MK0 819 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 POM121L1PQ3SYA9 428 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 CARD16Q5EG05 197 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRC73Q5JTD7 316 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARMC12Q5T9G4 340 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDPK2PQ6A1A2 396 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 PACS1Q6VY07 963 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 KDM7AQ6ZMT4 941 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTSS1LQ765P7 747 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 Q7L0L9 218 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 STRA8Q7Z7C7 330 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM135Q86UB9 458 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRABD2AQ86V40 505 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 TDRPQ86YL5 185 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 CMIPQ8IY22 773 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMRP1Q8NCR6 262 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR13C4Q8NGS5 318 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 HDAC10Q969S8 669 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 TTC17Q96AE7 1141 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 RANBP9Q96S59 729 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 SMC6Q96SB8 1091 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 RABEP2Q9H5N1 569 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 BRD9Q9H8M2 597 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPCSQ9HAB8 311 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 BPIFA1Q9NP55 256 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 LANCL2Q9NS86 450 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 EURLQ9NYK6 297 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 HS3ST2Q9Y278 367 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF711Q9Y462 761 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 LAMA3Q16787 3333 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 C5orf42Q9H799 3197 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYO9BQ13459 2157 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A1W2PPC1 479 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM120BA0PK00 339 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC162PA2VCL2 907 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 TBC1D3BA6NDS4 549 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANTXRLA6NF34 631 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 C2orf81A6NN90 581 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 ANKRD66B4E2M5 251 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 C2CD4DB7Z1M9 353 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 TPP1O14773 563 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 LDB2O43679 373 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 RRP9O43818 475 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 ECI2O75521 394 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPP40O75818 363 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRT38O76015 456 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 PGLSO95336 258 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPANK1O95872 356 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-202ENST00000559357 GOT2P00505 430 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms