RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LAMA1	P25391	3075 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SPTBN2	O15020	2390 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A0J9YYE9	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TSPAN11	A1L157	253 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FLRT2	O43155	660 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PSMD3	O43242	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	AQP9	O43315	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX2	O60749	519 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TRBC1	P01850	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	C1S	P09871	688 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ALPPL2	P10696	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CEACAM1	P13688	526 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KEL	P23276	732 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DGKA	P23743	735 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GRK6	P43250	576 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNJ1	P48048	391 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	VPS41	P49754	854 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	BLK	P51451	505 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC16A1	P53985	500 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	YPEL5	P62699	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MGAT2	Q10469	447 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	OVGP1	Q12889	678 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	RALGDS	Q12967	914 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MPP3	Q13368	585 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MTM1	Q13496	603 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	OLIG2	Q13516	323 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FZD2	Q14332	565 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	IHH	Q14623	411 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ODF1	Q14990	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CDSN	Q15517	529 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TAZ	Q16635	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CDKN3	Q16667	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PBK	Q96KB5	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	VAT1	Q99536	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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