RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		11.07	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MED13	Q9UHV7	2174 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FLNC	Q14315	2725 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	BSN	Q9UPA5	3926 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ISM1	B1AKI9	464 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TARM1	B6A8C7	271 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	HCRTR1	O43613	425 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	OR2B3	O76000	313 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ONECUT2	O95948	504 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CD63	P08962	238 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	IVD	P26440	423 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FMO4	P31512	558 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	LCN10	Q6JVE6	187 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CASC4	Q6P4E1	433 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CALML6	Q8TD86	181 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	RNF31	Q96EP0	1072 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FOPNL	Q96NB1	174 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TCFL5	Q9UL49	500 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MED16	Q9Y2X0	877 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CDC14C	A4D256	554 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ZNF185	O15231	689 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SLC28A2	O43868	658 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	NIPSNAP2	O75323	286 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	RFPL1	O75677	317 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ERG	P11308	486 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MAG	P20916	626 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	AGXT	P21549	392 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CLCN7	P51798	805 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PTK6	Q13882	451 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	NCF4	Q15080	339 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CYP2A13	Q16696	494 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	LONRF1	Q17RB8	773 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PCGF5	Q86SE9	256 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ZBTB2	Q8N680	514 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	KCNJ9	Q92806	393 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	GBP5	Q96PP8	586 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	NAT9	Q9BTE0	207 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	EURL	Q9NYK6	297 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SPATA7	Q9P0W8	599 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	ANAPC2	Q9UJX6	822 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	NFS1	Q9Y697	457 aa		11.05	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	PCM1	Q15154	2024 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	MYO1C	O00159	1063 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	SMAP	O00193	183 aa		11.04	□□□□□ -0.64
CS-223	ENST00000551137	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64

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