RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 EGLN2Q96KS0 407 aa20.38■□□□□ 0.85
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PRDM4-205ENST00000550376 FADS3Q9Y5Q0 445 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa20.38■□□□□ 0.85
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PRDM4-205ENST00000550376 CANT1Q8WVQ1 401 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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PRDM4-205ENST00000550376 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.36■□□□□ 0.85
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PRDM4-205ENST00000550376 RASGRP3Q8IV61 690 aa20.35■□□□□ 0.85
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PRDM4-205ENST00000550376 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 GLMNQ92990 594 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 SNX13Q9Y5W8 968 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 TIPRLO75663 272 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 CATP04040 527 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 ADGRE1Q14246 886 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-205ENST00000550376 CST6Q15828 149 aa20.35■□□□□ 0.85
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