RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549039.5

CTDSP2-205, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-205ENST00000549039 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 LRRC57Q8N9N7 239 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 DENND1AQ8TEH3 1009 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 DLG3Q92796 817 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PANX2Q96RD6 677 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ANAPC5Q9UJX4 755 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC39A10Q9ULF5 831 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC5A6Q9Y289 635 aa11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 A0A1B0GX78 115 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 IQCF5A8MTL0 148 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 BTNL10A8MVZ5 291 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 IFNB1P01574 187 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CD9P21926 228 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PKLRP30613 574 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CCR7P32248 378 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ARSFP54793 590 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PRAMEP78395 509 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 IGFL3Q6UXB1 125 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 VRK3Q8IV63 474 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SYCE1Q8N0S2 351 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 LINC01555Q8NAE3 123 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 OR13J1Q8NGT2 312 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 OR4L1Q8NH43 312 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 GSDMBQ8TAX9 411 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ASZ1Q8WWH4 475 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ATG4AQ8WYN0 398 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CNDP1Q96KN2 507 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 IL17FQ96PD4 163 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 FBXL4Q9UKA2 621 aa11.66□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CLDN1O95832 211 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 APOA4P06727 396 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 MMP11P24347 488 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 MCM3P25205 808 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 KIF5AQ12840 1032 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 HIF1AQ16665 826 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TSTD2Q5T7W7 516 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TTC23LQ6PF05 361 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 OVCH1Q7RTY7 1134 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CUZD1Q86UP6 607 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC22A15Q8IZD6 547 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 KRT222Q8N1A0 295 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 DNAJB14Q8TBM8 379 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 INPP5DQ92835 1189 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 AGAP4Q96P64 663 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 RANBP9Q96S59 729 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SELENOSQ9BQE4 189 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 ETNK1Q9HBU6 452 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC6A20Q9NP91 592 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 SLC22A11Q9NSA0 550 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 CUTCQ9NTM9 273 aa11.65□□□□□ -0.54
CTDSP2-205ENST00000549039 PCSK5Q92824 1860 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 S1PR4O95977 384 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 LDLRP01130 860 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 ADRA1DP25100 572 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 STIP1P31948 543 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 GRIA1P42261 906 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 OR1D4P47884 311 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SOX8P57073 446 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 SEMA3AQ14563 771 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 GRM7Q14831 915 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 TMED2Q15363 201 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 RBBP7Q16576 425 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 NKG7Q16617 165 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 TCTE1Q5JU00 501 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 Q6ZS92 163 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 RAB42Q8N4Z0 105 aa11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CTDSP2-205ENST00000549039 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms