RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 AGAP4Q96P64 663 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 OSGIN2Q9Y236 505 aa16.33■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CELSR2Q9HCU4 2923 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GX78 115 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 LRRTM2O43300 516 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 ALBP02768 609 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 PTMAP06454 111 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 C1QL3Q5VWW1 255 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 PACS1Q6VY07 963 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 TICAM1Q8IUC6 712 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 TC2NQ8N9U0 490 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 FAM71DQ8N9W8 422 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 GRHL3Q8TE85 626 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 FKBP10Q96AY3 582 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CNDP1Q96KN2 507 aa16.32■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 MROH6A6NGR9 719 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 SOCS6O14544 535 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 OR1I1O60431 355 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 ITGAXP20702 1163 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 PKLRP30613 574 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 FOXN2P32314 431 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 GRIA3P42263 894 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 RAB28P51157 221 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CDC16Q13042 620 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 NKG7Q16617 165 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CCDC38Q502W7 563 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 TAX1BP1Q86VP1 789 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 RNF214Q8ND24 703 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 TTC1Q99614 292 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CUTCQ9NTM9 273 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CIDEBQ9UHD4 219 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 NUP210LQ5VU65 1888 aa16.31■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 PCM1Q15154 2024 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 F8W8V4 182 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 DSCR3O14972 297 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 PSMD3O43242 534 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CD9P21926 228 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 MCM3P25205 808 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 TSFMP43897 325 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 GCGRP47871 477 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 PER3P56645 1201 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 HSPA14Q0VDF9 509 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 SF1Q15637 639 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 RBBP7Q16576 425 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 P3H1Q32P28 736 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 TUBB8Q3ZCM7 444 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 KIRREL2Q6UWL6 708 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 IGFL2Q6UWQ7 119 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 SLC34A3Q8N130 599 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 COG1Q8WTW3 980 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 IL17FQ96PD4 163 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 SPSB2Q99619 263 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 LHPPQ9H008 270 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 WDR54Q9H977 334 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 DOCK10Q96BY6 2186 aa16.3■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 EDN3P14138 238 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 PSMA3P25788 255 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 TNFRSF8P28908 595 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 CCR7P32248 378 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 OR1D4P47884 311 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 GRM7Q14831 915 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 TCTE1Q5JU00 501 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 FCRL6Q6DN72 434 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 LINC00696Q6ZRV3 163 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 COX15Q7KZN9 410 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 LINC00523Q86TU6 105 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 VRK3Q8IV63 474 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 SLC22A15Q8IZD6 547 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 DNAAF3Q8N9W5 541 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 OR52K1Q8NGK4 314 aa16.29■□□□□ 0.2
CS-214ENST00000548849 FAR1Q8WVX9 515 aa16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms