RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516222.1

RNU6-561P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 561, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-561P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-561P-201ENST00000516222 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 TNFAIP3P21580 790 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 CDH3P22223 829 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 PTGER4P35408 488 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 XGP55808 180 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 KRTAP10-10P60014 251 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 OLR1P78380 273 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 DMPKQ09013 629 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 PTP4A2Q12974 167 aa1.05□□□□□ -2.24
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RNU6-561P-201ENST00000516222 FAM189A2Q15884 450 aa1.05□□□□□ -2.24
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RNU6-561P-201ENST00000516222 CATSPERDQ86XM0 798 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 TMEM139Q8IV31 216 aa1.05□□□□□ -2.24
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RNU6-561P-201ENST00000516222 C4orf32Q8N8J7 132 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR52N5Q8NH56 324 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 C11orf45Q8TAV5 145 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 IRGQQ8WZA9 623 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 DACH2Q96NX9 599 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 DDOQ99489 341 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 APOL2Q9BQE5 337 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR2B2Q9GZK3 357 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 ITM2CQ9NQX7 267 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 CYTL1Q9NRR1 136 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 SELENOKQ9Y6D0 94 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 PDHXO00330 501 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 TNFSF14O43557 240 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 LATO43561 262 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 SNAP91O60641 907 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 PAGE4O60829 102 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 PCP11498 1178 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF17P17021 662 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 GIFP27352 417 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 LBX1P52954 281 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 GALCP54803 685 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 ERVK-16P61578 105 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 VAMP2P63027 116 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 CSNK2BP67870 215 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 GALNT2Q10471 571 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 CDH18Q13634 790 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 TAB1Q15750 504 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 ODF4Q2M2E3 257 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 REG3GQ6UW15 175 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 C3P1Q6ZMU1 363 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 CFAP206Q8IYR0 622 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 OR10G7Q8NGN6 311 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 TBC1D16Q8TBP0 767 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP1.04□□□□□ -2.24
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RNU6-561P-201ENST00000516222 LPAR4Q99677 370 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 OVOL2Q9BRP0 275 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 HGH1Q9BTY7 390 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 AMACRQ9UHK6 382 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF541Q9H0D2 1346 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 POGZQ7Z3K3 1410 aa1.04□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 HYKKA2RU49 373 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 SHISA7A6NL88 538 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 C2orf81A6NN90 581 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 BAIAP3O94812 1187 aa1.03□□□□□ -2.24
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RNU6-561P-201ENST00000516222 AOC1P19801 751 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 ELK3P41970 407 aa1.03□□□□□ -2.24
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RNU6-561P-201ENST00000516222 B3GALT5-AS1P59052 145 aa1.03□□□□□ -2.24
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RNU6-561P-201ENST00000516222 PPP2R2BQ00005 443 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 MYL7Q01449 175 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 TLE2Q04725 743 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 TRPC3Q13507 836 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 MORC3Q14149 939 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 KRT33BQ14525 404 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 ZNF146Q15072 292 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 GRAMD1BQ3KR37 738 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 XKR4Q5GH76 650 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 SLC25A53Q5H9E4 307 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 SPECC1Q5M775 1068 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 SLC35D3Q5M8T2 416 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 UTF1Q5T230 341 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-561P-201ENST00000516222 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa1.03□□□□□ -2.24
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