RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502575.1

PDE4D-209, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-209ENST00000502575 NR1D1P20393 614 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 MC4RP32245 332 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PRLHRP49683 370 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TUBB3Q13509 450 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 POU6F1Q14863 301 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 GPR19Q15760 415 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 NKG7Q16617 165 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 LONRF2Q1L5Z9 754 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SKIDA1Q1XH10 827 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 BCL7AQ4VC05 210 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KCTD11Q693B1 232 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PEX26Q7Z412 305 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PRUNE1Q86TP1 453 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PIANPQ8IYJ0 282 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CFAP206Q8IYR0 622 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ESX1Q8N693 406 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SPC24Q8NBT2 197 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 OR2L2Q8NH16 312 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CT55Q8WUE5 264 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ATG4AQ8WYN0 398 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SLC41A2Q96JW4 573 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 RAB33BQ9H082 229 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SEMA5BQ9P283 1151 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 EPHA6Q9UF33 1036 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SLC24A2Q9UI40 661 aa8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 OR6C74A6NCV1 312 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 C5orf60A6NFR6 353 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TLCD2A6NGC4 264 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 OR51F1A6NGY5 319 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 K7EM74 188 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KCNJ13O60928 360 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 STK10O94804 968 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CRTAMO95727 393 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 NTRK1P04629 796 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SLC35G4P0C7Q5 338 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TCN2P20062 427 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ITGALP20701 1170 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PDHA2P29803 388 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CCR10P46092 362 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 RPS18P62269 152 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SEPT6Q14141 434 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PRPSAP1Q14558 356 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 IL11RAQ14626 422 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CCDC38Q502W7 563 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 FAM69BQ5VUD6 431 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SNX20Q7Z614 316 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SERPINA9Q86WD7 417 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PPP1R3BQ86XI6 285 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 COG4Q9H9E3 785 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 ARNT2Q9HBZ2 717 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 AMFRQ9UKV5 643 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 PRSS21Q9Y6M0 314 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-209ENST00000502575 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 DBX1A6NMT0 343 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 KATNA1O75449 491 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 DNAJB5O75953 348 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 PGRP06401 933 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 ACRV1P26436 265 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 GDNFP39905 211 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 GRIA1P42261 906 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 TLE1Q04724 770 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 ABRQ12979 859 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 DNASE1L3Q13609 305 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 ERV3-1Q14264 604 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-209ENST00000502575 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.46□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms