RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NMUR2Q9GZQ4 415 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 VNN2O95498 520 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS56P0CW18 603 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MMP12P39900 470 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 GDF5P43026 501 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 CORO7P57737 925 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CREB5Q02930 508 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF678Q5SXM1 525 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZSR6 202 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TRPV3Q8NET8 790 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CLHC1Q8NHS4 586 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 CMTM7Q96FZ5 175 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 FADS3Q9Y5Q0 445 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 C2orf74A8MZ97 194 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 PLA2G16P53816 162 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 FOXM1Q08050 763 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 C1orf61Q13536 156 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 OXR1Q8N573 874 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RCN3Q96D15 328 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CDK15Q96Q40 435 aa8.07□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 NDEL1Q9GZM8 345 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SLC40A1Q9NP59 571 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NCDNQ9UBB6 729 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CDC14AQ9UNH5 594 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 LOC730098B7Z3J9 87 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 B3GALT2O43825 422 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 HS6ST1O60243 411 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 C1SP09871 688 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 FRMD7Q6ZUT3 714 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF555Q8NEP9 628 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 OR4F6Q8NGB9 312 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 DNAJB14Q8TBM8 379 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RLN3Q8WXF3 142 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 RPS14P62263 151 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 YPEL5P62699 121 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D21Q8IYX1 336 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRD-211ENST00000486161 RNF148Q8N7C7 305 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 SPPL2AQ8TCT8 520 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NAT14Q8WUY8 206 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 NCSTNQ92542 709 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 MYEOVQ96EZ4 313 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRD-211ENST00000486161 TBCDQ9BTW9 1192 aa8.06□□□□□ -1.12
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