RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 STX2P32856 288 aa16.29■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ABCG1P45844 678 aa16.29■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 BDKRB1P46663 353 aa16.29■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CLN3Q13286 438 aa16.29■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.29■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP16.29■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 CAPN12Q6ZSI9 719 aa16.29■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC16A5O15375 505 aa16.28■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 KLK10O43240 276 aa16.28■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 ST6GAL1P15907 406 aa16.28■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 GP5P40197 560 aa16.28■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 TUBB4BP68371 445 aa16.28■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 DENND1AQ8TEH3 1009 aa16.28■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 OLFM1Q99784 485 aa16.28■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 CTRCQ99895 268 aa16.28■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 A0A0J9YY10 115 aa16.27■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa16.27■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF839A8K0R7 811 aa16.27■□□□□ 0.2
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 ELMO2Q96JJ3 720 aa16.27■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 PKP4Q99569 1192 aa16.27■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 SOHLH2Q9NX45 425 aa16.27■□□□□ 0.2
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RABGEF1-204ENST00000442563 UCNP55089 124 aa16.26■□□□□ 0.19
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 LINGO1Q96FE5 620 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 FUT8Q9BYC5 575 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 FANCEQ9HB96 536 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PARVBQ9HBI1 364 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
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RABGEF1-204ENST00000442563 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa16.26■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PPV9 198 aa16.25■□□□□ 0.19
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