RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 ARSKQ6UWY0 536 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 B3GLCTQ6Y288 498 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CHSY1Q86X52 802 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM126BQ8IUX1 230 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC5A8Q8N695 610 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MAP4K1Q92918 833 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SLCO4A1Q96BD0 722 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 RHBDF1Q96CC6 855 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TUBGCP3Q96CW5 907 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MTERF3Q96E29 417 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 LINGO1Q96FE5 620 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ASCL2Q99929 193 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF559Q9BR84 538 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ACPTQ9BZG2 426 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM234AQ9H0X4 552 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ATG10Q9H0Y0 220 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CUEDC2Q9H467 287 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNMB3Q9NPA1 279 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CNGB3Q9NQW8 809 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 OSER1Q9NX31 292 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 LTBP4Q8N2S1 1624 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 HEG1Q9ULI3 1381 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TEX14Q8IWB6 1497 aa4.49□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A087WZY1 265 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2M5A3KFT3 312 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SMIM22K7EJ46 135 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 E2F3O00716 465 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PLSCR1O15162 318 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 THRBP10828 461 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 BDKRB2P30411 391 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PLCD1P51178 756 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CNN1P51911 297 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TAS2R38P59533 333 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 RUNX1T1Q06455 604 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC34A1Q06495 639 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PLA2G7Q13093 441 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PTPAQ15257 358 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PTGISQ16647 500 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 GCNT6Q5T4J0 391 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ATAD3BQ5T9A4 648 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 C18orf63Q68DL7 685 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF585AQ6P3V2 769 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF813Q6ZN06 617 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MRGPREQ86SM8 312 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TMPRSS11BQ86T26 416 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ASPGQ86U10 573 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 AMIGO1Q86WK6 493 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF573Q86YE8 665 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 APCDD1Q8J025 514 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 LEMD2Q8NC56 503 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 OR52K2Q8NGK3 314 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 TRIB2Q92519 343 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC9A6Q92581 669 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 EXTL1Q92935 676 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM46BQ96A09 425 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 EME1Q96AY2 570 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 NECTIN4Q96NY8 510 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 RAD9AQ99638 391 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 C17orf62Q9BQA9 187 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MLST8Q9BVC4 326 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PALMDQ9NP74 551 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SYBUQ9NX95 663 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 NPAP1Q9NZP6 1156 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXL2Q9UKC9 423 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 CDC14AQ9UNH5 594 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SNX6Q9UNH7 406 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNJ14Q9UNX9 436 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PLB1Q6P1J6 1458 aa4.48□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 FHAD1B1AJZ9 1412 aa4.47□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 NCAPD2Q15021 1401 aa4.47□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PPK0 400 aa4.47□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.47□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 H0YIG0 161 aa4.47□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 SOCS6O14544 535 aa4.47□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHL41O60662 606 aa4.47□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PRAMEF12O95522 483 aa4.47□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 GSRP00390 522 aa4.47□□□□□ -1.69
CBX1P4-201ENST00000439415 PCCBP05166 539 aa4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms