RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427487.5

HDLBP-215, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-215ENST00000427487 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 ANKRD42Q8N9B4 389 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 OR52E1Q8NGJ3 308 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF480Q8WV37 535 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 SMPDL3AQ92484 453 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 NAT6Q93015 286 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 CNDP1Q96KN2 507 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
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HDLBP-215ENST00000427487 SLC32A1Q9H598 525 aa11.7□□□□□ -0.54
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HDLBP-215ENST00000427487 B4DGG1 531 aa11.69□□□□□ -0.54
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HDLBP-215ENST00000427487 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 KATNA1O75449 491 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 MLYCDO95822 493 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 SERPINE1P05121 402 aa11.69□□□□□ -0.54
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HDLBP-215ENST00000427487 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF678Q5SXM1 525 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 ATG16L1Q676U5 607 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 AMIGO1Q86WK6 493 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 C10orf107Q8IVU9 208 aa11.69□□□□□ -0.54
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HDLBP-215ENST00000427487 MAGEB18Q96M61 343 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 HAUS8Q9BT25 410 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 HGH1Q9BTY7 390 aa11.69□□□□□ -0.54
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HDLBP-215ENST00000427487 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.69□□□□□ -0.54
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HDLBP-215ENST00000427487 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
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HDLBP-215ENST00000427487 UGDHO60701 494 aa11.68□□□□□ -0.54
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HDLBP-215ENST00000427487 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 DRC3Q9H069 523 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 EHD1Q9H4M9 534 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 MANSC1Q9H8J5 431 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 OPTCQ9UBM4 332 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 HAO1Q9UJM8 370 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 PADI4Q9UM07 663 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 ICKQ9UPZ9 632 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-215ENST00000427487 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
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