RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 RASA2Q15283 850 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 RAPH1Q70E73 1250 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CEP97Q8IW35 865 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 PHC3Q8NDX5 983 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 FOPNLQ96NB1 174 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TAAR9Q96RI9 348 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 DDA1Q9BW61 102 aa20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 A0A087WV48 116 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 HMX2A2RU54 273 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 MPC1LP0DKB6 136 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CD82P27701 267 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 IL2P60568 153 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 PRKG2Q13237 762 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CYB5D1Q6P9G0 228 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 AMIGO1Q86WK6 493 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 CARFQ8N187 725 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 MYO1HQ8N1T3 1032 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 OR4E2Q8NGC2 313 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 KCNE4Q8WWG9 221 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 USP7Q93009 1102 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 LINGO1Q96FE5 620 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SNX15Q9NRS6 342 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 SLC39A1Q9NY26 324 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TBK1Q9UHD2 729 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa20.15■□□□□ 0.82
C4orf48-201ENST00000409248 TLDC2A0PJX2 215 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PRAMEF10O60809 474 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TYK2P29597 1187 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PGGT1BP53609 377 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PPP1CAP62136 330 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ABRQ12979 859 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 KMT5CQ86Y97 462 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 BMPERQ8N8U9 685 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ISL2Q96A47 359 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM109Q9BVC6 243 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 OCIAD1Q9NX40 245 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TLK1Q9UKI8 766 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ADAMTS20P59510 1910 aa20.14■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 GSAPA4D1B5 854 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SEPHS1P49903 392 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 MC2RQ01718 297 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 DCAF12Q5T6F0 453 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TTC23LQ6PF05 361 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CROCCP2Q86T23 111 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 IQCKQ8N0W5 287 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CFAP61Q8NHU2 1237 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ZIM3Q96PE6 472 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ZPBPQ9BS86 351 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SEMA5BQ9P283 1151 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 POMT2Q9UKY4 750 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ICKQ9UPZ9 632 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 NFS1Q9Y697 457 aa20.13■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 A0A087X1B8 175 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 C2orf74A8MZ97 194 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 C9orf172C9J069 976 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ARL4DP49703 201 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF844Q08AG5 666 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CASP8Q14790 479 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 KRT71Q3SY84 523 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM207Q6UWW9 146 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CEACAM20Q6UY09 585 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TIFABQ6ZNK6 161 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SPNS2Q8IVW8 549 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 MAP3K3Q99759 626 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms