RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 C4orf22Q6V702 233 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ZNF534Q76KX8 674 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 MRGPREQ86SM8 312 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 GALNT16Q8N428 558 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 STYXQ8WUJ0 223 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ELMO1Q92556 727 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 PTERQ96BW5 349 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 CAPZA3Q96KX2 299 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 C5orf34Q96MH7 638 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 KLHL25Q9H0H3 589 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 XKR8Q9H6D3 395 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 OR6C2Q9NZP2 312 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 A0A0J9YY10 115 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 OR51F1A6NGY5 319 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 SEMA7AO75326 666 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 CAPN1P07384 714 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 PVRP15151 417 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 UGT2B7P16662 529 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 CRADDP78560 199 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 RAPSNQ13702 412 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ITIH4Q14624 930 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 KCNJ11Q14654 390 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 KIR2DS3Q14952 304 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ZNF789Q5FWF6 425 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 DCAF10Q5QP82 559 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ANKRD22Q5VYY1 191 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 PIANPQ8IYJ0 282 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 OR13J1Q8NGT2 312 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 OR2Y1Q8NGV0 311 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 NACC2Q96BF6 587 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 SLC22A18Q96BI1 424 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 RANBP9Q96S59 729 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 PLCL2Q9UPR0 1127 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 SAR1BQ9Y6B6 198 aa13.55□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 RELNP78509 3460 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 A1L4Q6 167 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 CCDC162PA2VCL2 907 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 CTAGE9A4FU28 777 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ENO4A6NNW6 628 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ISM1B1AKI9 464 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 TPSB2P20231 275 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ITGAXP20702 1163 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ADRA1DP25100 572 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 PDHA2P29803 388 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ARSFP54793 590 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 TPSAB1Q15661 275 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 TSTD2Q5T7W7 516 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 C1orf189Q5VU69 101 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 IGFL3Q6UXB1 125 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 UNC5AQ6ZN44 842 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 CLDN19Q8N6F1 224 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 Q8NA96 180 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 OR5K2Q8NHB8 316 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 GSDMBQ8TAX9 411 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 CHRAC1Q9NRG0 131 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 P4HTMQ9NXG6 502 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ICKQ9UPZ9 632 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 SLC5A6Q9Y289 635 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 PCM1Q15154 2024 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 FER1L5A0AVI2 2057 aa13.54□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 TEX15Q9BXT5 2789 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 HEATR9A2RTY3 570 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ANKUB1A6NFN9 424 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 AVILO75366 819 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ATXN8OSP0DMR3 200 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 MAGEA6P43360 314 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 FNTAP49354 379 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 PER3P56645 1201 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 ACVR1Q04771 509 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 BRD3Q15059 726 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 NR6A1Q15406 480 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 SLC5A12Q1EHB4 618 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 DEFB110Q30KQ9 67 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa13.53□□□□□ -0.24
CITED1-202ENST00000373619 FAM69BQ5VUD6 431 aa13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms