RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335046.7

UBE2C-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene UBE2C, Length 737 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-202ENST00000335046 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PROSER1Q86XN7 944 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 USP7Q93009 1102 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 OR2A14Q96R47 310 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 NRTNQ99748 197 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SLC12A9Q9BXP2 914 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ACSL6Q9UKU0 697 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 BTRCQ9Y297 605 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ISM1B1AKI9 464 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ACSL3O95573 720 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 TSPAN12O95859 305 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ERGP11308 486 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 UGT2B7P16662 529 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SAT1P21673 171 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ACY1Q03154 408 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 IL11RAQ14626 422 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 USP10Q14694 798 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 CCSMST1Q4G0I0 132 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 TMTC4Q5T4D3 741 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 DCAF12Q5T6F0 453 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 D2HGDHQ8N465 521 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 LINC01555Q8NAE3 123 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 IL17FQ96PD4 163 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PARVBQ9HBI1 364 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 GPAMQ9HCL2 828 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SPHK1Q9NYA1 384 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 AGRPO00253 132 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 STMN1P16949 149 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SLC5A2P31639 672 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 DENND1AQ8TEH3 1009 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PKP4Q99569 1192 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 TRIM54Q9BYV2 358 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 A0A0J9YY10 115 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ABHD2P08910 425 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 HIST1H2ADP20671 130 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 OAS2P29728 719 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PMS2P54278 862 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 CEP97Q8IW35 865 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SMPDL3AQ92484 453 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 CCDC138Q96M89 665 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 HIST1H2AJQ99878 128 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 H2AFJQ9BTM1 129 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PDE7BQ9NP56 450 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SOHLH2Q9NX45 425 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 CIDEBQ9UHD4 219 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ACACAQ13085 2346 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 C9orf172C9J069 976 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PRAMEF10O60809 474 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 MSL3P1P0C860 447 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 FOXM1Q08050 763 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 TMEM207Q6UWW9 146 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 CCDC91Q7Z6B0 441 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ZNF248Q8NDW4 579 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 OR8K5Q8NH50 307 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 TCTN2Q96GX1 697 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PPM1MQ96MI6 270 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 FCRL4Q96PJ5 515 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PDE10AQ9Y233 779 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 IKBKGQ9Y6K9 419 aa21.34■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 FAM155BO75949 473 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SLC16A8O95907 504 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SYF2O95926 243 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ST6GAL1P15907 406 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 CRABP2P29373 138 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SERPINB9P50453 376 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 PNLIPRP1P54315 467 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 AP1S2P56377 157 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 RAB10P61026 200 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 NAA25Q14CX7 972 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP21.33■■□□□ 1.014e-7■■■■□ 23.1
UBE2C-202ENST00000335046 SF1Q15637 639 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 CNPY4Q8N129 248 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 ZNF480Q8WV37 535 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 SLC44A1Q8WWI5 657 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 DLG3Q92796 817 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2C-202ENST00000335046 OR6C1Q96RD1 312 aa21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms