RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303230.5

HCN1-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN1, Length 9,885 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN1-201ENST00000303230 BRD7Q9NPI1 651 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 HACL1Q9UJ83 578 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 DUXAA6NLW8 204 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 LRCH4O75427 683 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PAGE1O75459 146 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 UGT2B10P36537 528 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PBX3P40426 434 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SLC39A12Q504Y0 691 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 FAM151BQ6UXP7 276 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SCN4AP35499 1836 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GABBR2O75899 941 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 KCNA5P22460 613 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GDI2P50395 445 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GID4Q8IVV7 300 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 HYLS1Q96M11 299 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TMEM184CQ9NVA4 438 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MATN1P21941 496 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 KELP23276 732 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TBRG1Q3YBR2 411 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 DOK6Q6PKX4 331 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GAL3ST3Q96A11 431 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ABCD2Q9UBJ2 740 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 IMPDH1P20839 514 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 KXD1Q9BQD3 176 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MCMBPQ9BTE3 642 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 IL3P08700 152 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 NDST2P52849 883 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 COL28A1Q2UY09 1125 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 FXYD6Q9H0Q3 95 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 RPP38P78345 283 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 DNM1P34Q6PK57 102 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PCDH10Q9P2E7 1040 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TJP1Q07157 1748 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 DISC1C4P0D8 188 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 H3BSA7 217 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 NSG1P42857 185 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TMEM199Q8N511 208 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GADD45AP24522 165 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 VAMP2P63027 116 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MXD1Q05195 221 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CLEC6AQ6EIG7 209 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 BRSK1Q8TDC3 778 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PIGKQ92643 395 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 RFPL1O75677 317 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 S100PP25815 95 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PIGZQ86VD9 579 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TSSK3Q96PN8 268 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MRIQ9BWK5 157 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ITGB1P05556 798 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CYP3A5P20815 502 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 UTS2BQ765I0 119 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 EXO5Q9H790 373 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 EDARQ9UNE0 448 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 KIF26BQ2KJY2 2108 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 FOXN2P32314 431 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 BTBD16Q32M84 506 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 AMIGO1Q86WK6 493 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CXorf40BQ96DE9 158 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TMEM80Q96HE8 168 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SNX10Q9Y5X0 201 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 PSEN2P49810 448 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SEMA5AQ13591 1074 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 OR5T3Q8NGG3 340 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 KAZALD1Q96I82 304 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 IDI2Q9BXS1 227 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GMFGO60234 142 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 SLC30A10Q6XR72 485 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 ATAD1Q8NBU5 361 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 CHST4Q8NCG5 386 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 TLR4O00206 839 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 MAFO75444 373 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 FAM46DQ8NEK8 389 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 HCN2Q9UL51 889 aa16.59■□□□□ 0.25
HCN1-201ENST00000303230 STUB1Q9UNE7 303 aa16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms