RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 FGL2Q14314 439 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 PON2Q15165 354 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 TIGD2Q4W5G0 525 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 GANCQ8TET4 914 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 CD300AQ9UGN4 299 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SNX6Q9UNH7 406 aa22.13■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ADAM23O75077 832 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SEC22BO75396 215 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 VHLP40337 213 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 MAPK9P45984 424 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ADGRE1Q14246 886 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 COQ5Q5HYK3 327 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ZFAND4Q86XD8 727 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC58Q96CX6 371 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 OR4K3Q96R72 315 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 MGAT4DA6NG13 374 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 E7EQ34 232 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 CD22P20273 847 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 COL9A1P20849 921 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 PRKG2Q13237 762 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 INPP5AQ14642 412 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 PTGR1Q14914 329 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 HM13Q8TCT9 377 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ASB9Q96DX5 294 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 GABRG3Q99928 467 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 NMRK1Q9NWW6 199 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SLC23A2Q9UGH3 650 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 OR1A2Q9Y585 309 aa22.12■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 H3BNX3 289 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 EEDO75530 441 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 IRF8Q02556 426 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 TLR1Q15399 786 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SDE2Q6IQ49 451 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 OR56A3Q8NH54 315 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM8Q9BZR9 551 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 TM7SF3Q9NS93 570 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 GID8Q9NWU2 228 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PQF6 199 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 CLGNO14967 610 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 CASP2P42575 452 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 NFYCQ13952 458 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 STARD3Q14849 445 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 IRF4Q15306 451 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 XKR6Q5GH73 641 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 RNF175Q8N4F7 328 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 C1orf109Q9NX04 203 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SLAMF8Q9P0V8 285 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 HOXB2P14652 356 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 JUPP14923 745 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0040Q15053 153 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SMU1Q2TAY7 513 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 LIX1Q8N485 282 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF480Q8WV37 535 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 DPEP2Q9H4A9 486 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 TMEM45AQ9NWC5 275 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 NME4O00746 187 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 JAK1P23458 1154 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SLC6A2P23975 617 aa22.09■■□□□ 1.13
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VSTM4-201ENST00000298454 AGERQ15109 404 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 LIPJQ5W064 366 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 FRG2Q64ET8 278 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SLC2A7Q6PXP3 512 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SUSD1Q6UWL2 747 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 FRG2BQ96QU4 278 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 TEX101Q9BY14 249 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 ABCD2Q9UBJ2 740 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 TRPM6Q9BX84 2022 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 DNTTP04053 509 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 IGFBP4P22692 258 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 DGKQP52824 942 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM4-201ENST00000298454 DOC2AQ14183 400 aa22.09■■□□□ 1.13
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